РНК—НОСИТЕЛЬ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ИНФОРМАЦИИ
Изучение генетики микроорганизмов позволило открыть много новых явлений, в том числе было доказано, что у вируса табачной мозаики (ВТМ), поражающего растения рода Nico-tiana, наследственную информацию несет молекула РНК-
Доказано это было так. Кроме молекулы РНК, свернутой в виде спирали, вирус состоит еще из белковой оболочки. Если отделить белок от РНК, то он не обладает инфекционностью, в отличие от РНК, которая при нанесении на листья табака вызывает характерные для данного заболевания некротические пятна. Было показано, что можно в пробирке при определенных условиях, смешивая РНК и белок даже от разных вирусов, восстанавливать вирусные частицы. Были взяты 2 штамма ВТМ и разделены на РНК и белок. В результате получили 4 компонента. Потом смешали их во всех возможных сочетаниях и получили 4 рода частиц: 2 исходные и 2 новые «гибридные», которые имели РНК одного штамма, а белок другого. «Гибридные» частицы ВТМ после заражения ими растений репродуцировали новые вирусные частицы. Интересно, что РНК этих синтетических гибридов синтезировали только свой собственный белок, т. е. белок штамма, из которого была выделена РНК-После заражения восстановились лишь исходные штаммы ВТМ, а «гибридные» формы не воспроизводились.
Эти данные можно объяснить, очевидно, только тем, что наследственную информацию, определяющую структуру белка, у ВТМ несет РНК.
Среди вирусов, паразитирующих в клетках животных и человека, известны формы, имеющие не ДНК, а РНК (например, вирусы, вызывающие полиомиелит, энцефалит и др.).
|
|
* *
*
Итак, открытия новых явлений (трансформация, трансдук-ция, наличие эписом) при изучении микроорганизмов значительно расширили наши представления о материальных носителях наследственности и убедительно показали, что роль носителя наследственной информации в клетке играет ДНК независимо от ее организации (отдельные молекулы или хромосомы) и локализации (ядро или цитоплазма) в клетке. У некоторых вирусов носителем наследственной информации может быть РНК.
Глава 16. ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД
После того как были получены убедительные данные в пользу того, что ДНК является носителем наследственной информации, стало ясно, что специфическим компонентом гена является ДНК. И тогда встали вопросы: какова генетическая организация ДНК (первая функция гена как носителя наследственной информации) и как ДНК определяет признаки и свойства организма в онтогенезе (вторая функция) ?
В центр генетических исследований был поставлен постулат Менделя — Моргана: «ген— признак-».
Значительный прогресс в понимании функции гена достигнут благодаря исследованиям, заложившим основы биохимической генетики. На многих микроорганизмах было показано, что большинство генов контролирует синтез специфических белков-ферментов: мутации генов выражаются прежде всего в изменении или потере активности соответствующих ферментов. У человека, как уже было сказано в главе 13, такие заболевания, как алкаптонурия, фенилкетонурия и другие, также связаны с нарушением ферментативной деятельности вследствие мутаций отдельных генов. Эти факты позволили Г. Бидлу и Е. Та-туму выдвинуть положение: «один ген — один фермент». В настоящее время это положение следует понимать в том смысле, что для каждого белка существует ген, контролирующий его структуру и активность.
|
|
Под влиянием новых фактов были произведены дальнейшая конкретизация и уточнение этого положения. Так было показано, что в молеукле гемоглобина человека, состоящей из четырех цепей — двух а- и двух р-цепей, каждая цепь генетически контролируется отдельно. Этот и другие подобные ему факты позволили ввести более точный постулат: «один ген — одна полипептидная цепь». А сейчас попробуем уточнить, что именно в полипептидной цепи контролируется генетически. В случае тяжелого наследственного заболевания крови у человека — серповидно-клеточной анемии в результате мутации происходит изменение свойств гемоглобина. При этом в молекуле гемоглобина, состоящей из 574 аминокислотных остатков, происходит замена лишь одного: глутаминовая кислота заменяется валином. Отсюда можно сделать вывод, что ген контролирует аминокислотный состав полипептидных цепей и белков.
|
|
1. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ДНК
Гипотеза последовательности. Как записана информация в ДНК? Для того чтобы ответить на этот вопрос, надо вспомнить строение молекулы ДНК (гл. 2), с одной стороны, и строение белков, с другой стороны. В состав ДНК входят 4 основания (аденин и гуанин — пуриновые, тимин и цитозин — пиримидино-вые основания), определяющие ее специфичность. В состав белков входят 20 аминокислот. Именно они, их последовательность в полипептидных цепях определяют не только первичную структуру, но и все последующие, вплоть до четвертичной структуры белковой молекулы, а следовательно, все разнообразие и специфичность белков. Значит, можно предположить, что в последовательности нуклеотидов в ДНК может быть записана наследственная информация о последовательности аминокислот в белковой молекуле.
|
|
Это положение было развито Ф. Криком в виде гипотезы последовательности.
Справедливость «гипотезы последовательности» была доказана, в частности, работами С. Яновского с сотрудниками. Авторы исследовали тонкую структуру локуса, контролирующего фермент триптофансинтетазу у Escherichia coli, и нашли девять мутаций, которые представляли собой изменения в последовательности нуклеотидов в молекуле ДНК. Изучение аминокислотной последовательности в белке-ферменте у мутантных форм показало, что она изменяется параллельно изменению последовательности нуклеотидов в ДНК, т. е. была доказана колинеар-ность гена и контролируемого им белка.
Но как именно записана, зашифрована наследственная информация в ДНК? Впервые идея о том, что генетическая информация закодирована * в генах, была высказана Д. Гамовым в 1954 г.
Основные черты генетического кода. В настоящее время благодаря усилиям генетиков, биохимиков, цитологов и других специалистов стали известны основные черты генетического кода.
Прежде всего код является триплетным, т. е. каждую аминокислоту кодирует триплет оснований (кодон). Простой расчет показывает, что из четырех оснований по 3 можно создать 64 различные комбинации, что вполне достаточно для кодирования 20 аминокислот. Но, кроме теоретических расчетов, Ф. Криком с сотрудниками были получены прямые экспериментальные доказательства триплетности кода при изучении мутации г II фага Тц, поражающего кишечную палочку.
1 Изображение одних объектов посредством других называется в кибернетике кодированием.
272
Обозначим сочетание из трех пар нуклеотидов как abc. Далее допустим, что такие триплеты повторяются последовательно в отрезке молекулы ДНК:
abc abc abc abc . . .
Представим себе, что произошла мутация, например, вставка лишнего нуклеотида а (указано стрелкой), тогда весь последующий порядок «считывания» («текста») триплетов нарушится, если код считывается слева направо тройками:
Ф abcaabcabcabc -+ abc aab cab cab с . ..
Допустим, что после этого где-то недалеко вправо от первоначальной мутации возникла новая мутация, заключающаяся в выпадении одного какого-нибудь основания, например, с (указано стрелкой):
У У У У
abcaabcab abc -» abc aab cab abc ...
В данном случае нарушение «текста» имеет место только на участке между двумя мутациями (указано стрелками), на. всем остальном протяжении сохраняется прежний порядок считывания. Если данная часть гена, в которую входит несколько измененных триплетов, не выполняет какой-нибудь ответственной функции, то можно представить, что нарушение кода на каком-то небольшом участке не скажется заметным образом на конечном результате. Особи, несущие два таких изменения, будут иметь фенотип, приближающийся к дикому типу, что и было показано экспериментально.
Если код действительно является триплетным, то комбинации двух вставок оснований (или двух выпадений), в отличие от предыдущего случая, должны всегда давать мутантный фенотип. Это также подтверждено экспериментально. Если у фага Г4 дикого типа последовательность нуклеотидов (2-я строчка) и определяемых ими аминокислот (1-я строчка):
Лиз Сер Про Сер Лей Асп Ала AAA АГУ ЦЦА УЦА ЦУУ ААУ ГЦУ,
то при вставке двух нуклеотидов Г я У (отмечено скобкой) получится следующая последовательность:
AAA АГУ "ГУЦ ЦАУ ЦАЦ УУА АУГ ЦУ Лиз Сер Вал Гис Гис Лей Mem.
В соответствии с этим изменится и аминокислотный состав белка (нижняя строчка), что и было зарегистрировано как мутация.
I" Генетики с основами селекции 273
В случае триплетности кода комбинации трех вставок и выпадений при достаточно близком расположении их друг около друга должны давать фенотип, приближающийся к норме, поскольку в этом случае восстанавливается нормальный порядок считывания кода. Эти предположения также получили экспериментальное подтверждение при скрещивании определенных мутантов фага 7V
Итак, результаты скрещивания во всех случаях соответствовали заранее предсказанным, что и явилось подтверждением гипотезы о триплетности кода.
Как следует из предыдущих рассуждений, код является неперекрывающимся, т. е. один и тот же нуклеотид не может входить одновременно в состав двух соседних триплетов. Это получило экспериментальное доказательство в только что упомянутых работах Крика. Однако были поставлены и прямые эксперименты, доказывающие это положение. С помощью азотистой кислоты у вируса табачной мозаики была получена мутация, связанная с заменой только одного основания (цитозина на урацил). В белке, синтезируемом этим вирусом, было показано изменение только одной аминокислоты.
Код, исходя из приведенных расчетов (64 кодона на 20 аминокислот), должен быть «вырожденным», т. е. одна и та же аминокислота должна определяться несколькими кодонами. Эти расчеты позволяют предположить также наличие «бессмысленных» триплетов, т. е. таких, которые не кодируют ни одну из аминокислот. Эти предположения получили экспериментальные доказательства, о которых пойдет речь несколько позже.
Код характеризуется тем, что чтение его начинается всегда с определенного пункта. Экспериментальные доказательства этого также были получены Криком при исследовании рекомбинаций у мутантных фагов Г4.
В экспериментах со вставками и выпадениями оснований было показано, что код считывается без запятых, т. е. если произойдет выпадение одного нуклеотида, то при считывании его место занимает ближайший нуклеотид из соседнего кодона, благодаря чему изменяется весь порядок считывания.
В настоящее время ведутся интенсивные исследования по расшифровке генетического кода, а потому постоянно идет конкретизация, уточнение, дополнение и даже исправление ранее высказанных положений.
2. ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОНТРОЛЬ СИНТЕЗА БЕЛКА
Механизмы белкового синтеза. После того как были получены сведения о коде, встал вопрос о том, какова же роль ДНК в синтезе белка?
274
ДНК несет в себе информацию для синтеза полипептидной цепи с определенной аминокислотной последовательностью, однако она не принимает непосредственного участия в синтезе белка. ДНК служит лишь матрицей для синтеза молекулы информационной РНК (и-РНК) —первого продукта гена.
В настоящее время принято считать, что цепочки спирали ДНК неравнозначны: на одной из них зашифрована структура полипептида — она имеет смысловое значение, а другая, комплементарная ей, представляет собой так называемую антисмысловую цепочку. Именно смысловая цепочка служит матрицей для синтеза (транскрипции) одиночной цепи и-РНК (см. рис. на стр. 256). Под контролем фермента РНК-полимер азы происходит переписывание кода смысловой цепочки ДНК на и-РНК, причем и-РНК комплементарна к смысловой цепочке ДНК. Это значит, если известна последовательность в одной цепи, то в другой ее можно вывести автоматически. Так, если кодон в ДНК, контролирующий синтез валина, ЦАА, то в и-РНК он будет ГУУ. Каждая молекула и-РНК существует в клетке несколько минут, после чего ген отпечатывает новые молекулы и-РНК- Молекула и-РНК поступает в цитоплазму, где и контактирует с рибосомами. Комплекс из и-РНК и рибосом носит название полирибосомы или полисомы. Именно на полисомах происходит синтез белка (трансляция).
Рибосомы представляют собой структуры, состоящие из высокополимерной рибосомной РНК (р-РНК) и из белка. Роль р-РНК не выяснена. Каждая рибосома движется вдоль молекулы и-РНК, и тем временем растет полипептидная цепочка. Длина цепочки пропорциональна расстоянию, пройденному рибосомой от начала молекулы и-РНК. Число аминокислот в таком белковом фрагменте равно числу триплетов, которые успела «прочесть» рибосома.
Выстраивание аминокислотных остатков в соответствии с триплетами (кодонами) и-РНК осуществляется на рибосомах при помощи еще одного типа молекул РНК, а именно транспортных РНК (т-РНК)- Т-РНК — низкополимерны, отдельная молекула состоит примерно из 70 нуклеотидов. В этой молекуле большинство водородных связей замкнуто благодаря комплементарному взаимодействию оснований. Согласно одной из моделей строения т-РНК предполагается, что молекула имеет форму, напоминающую клеверный лист, к «черенку» которого и присоединяется аминокислота. Соединение с аминокислотой, очевидно, обусловливается формой молекулы т-РНК. Существуют и другие модели. Так, согласно одной из них т-РНК представляет собой полинуклеотидный тяж, сложенный пополам и скрученный таким образом, что образовалась двойная спираль наподобие ДНК. В точке перегиба остаются три неспаренных нуклеотида, которые названы антикодонами. Именно триплет
антикодона т-РНК благодаря наличию незамещенных водородных связей может взаимодействовать с находящимся на рибосоме триплетом кодона и-РНК. Другой конец молекулы т-РНК служит для соединения с аминокислотой. Независимо от строения молекулы т-РНК каждый класс молекул может соединяться только с одной аминокислотой; следовательно, количество разных типов молекул т-РНК должно быть не менее двадцати. Это взаимодействие контролируют высокоспецифичные активирующие ферменты.
Итак, различные молекулы т-РНК приносят к рибосоме аминокислоты и располагают их соответственно последовательности триплетов и-РНК. Точность считывания генетической информации зависит не только от того, какие кодоны проходят через рибосому, но в значительной мере и от состояния самой рибосомы. Стоит изменить структуру рибосомы, присоединив, к ней, например, молекулы антибиотика стрептомицина, или повысить концентрацию ионов Mg++ в окружающей среде, как генетический код, отпечатанный в и-РНК, начинает считываться неправильно: рибосома «читает» с ошибками, часто включает «не те» аминокислоты в полипептидную цепь. Именно с этим и связано инактивирующее действие стрептомицина на бактериальные клетки. В норме синтез белка идет без ошибок и с большой скоростью: 2 аминокислоты за 1 секунду. Молекула белка, состоящая из 150 аминокислот, синтезируется на одной полисоме приблизительно за 1,5 минуты.
Генетический контроль. Понимание основных моментов механизма белкового синтеза позволило моделировать этот процесс in vitro. Этому способствовало два биохимических открытия: получение бесклеточных систем, в которых может идти синтез белка, и ферментативный синтез искусственных полири-бонуклеотидов.
М. Ниренберг и Г. Маттэй в 1961 г. показали, что искусственно синтезированные полирибонуклеотиды определенного состава, введенные в бесклеточную систему, содержащую рибосомы, полный набор аминокислот и некоторые ферменты, могут дей-' ствовать в ней в качестве и-РНК. Помещая искусственно синтезированную информационную РНК, в состав которой входил только урацил (полиуридиловая кислота, поли-У), в бесклеточную систему, полученную из Escherichia coli, удалось обеспечить синтез белка определенного состава. При анализе выпадающего в осадок полипептида выяснилось, что, несмотря на наличие в среде всех аминокислот, в его состав входила только одна аминокислота, а именно фенилаланин, т. е. полиуридиловая кислота стимулировала синтез полифенилаланина. Тем самым была прочтена первая буква генетического кода: триплет урацилтурацил-урацил (УУУ), который контролирует включение в полипептидную цепочку аминокислоты фенилаланин.
276
К настоящему времени благодаря исследованиям М. Нирен-берга и других расшифрованы триплеты для всех аминокислот (табл. 13). Обратите внимание на то, что каждой аминокислоте соответствует несколько триплетов — кодонов, т. е. код вырожден.
Таблица 13 Список аминокислот и соответствующих им кодонов и-РНК
1-е | 2-е | 3-е основание | |||
основа- | основание | ||||
ние | У | Ц | А | г | |
У | Фен | Фен | Лей | Лей | |
У | ц | Сер | Сер | Сер | Сер |
А | " Тир | Тир | * | * | |
Г | Цис | Цис | * | Три | |
У | Лей | Лей | Лей | Лей | |
ц | Ц | Про | Про | Про | Про |
А | Гис | Гис | ГлуЫН2 | ГлуЫН2 | |
Г | Apr | Apr | Apr | Apr | |
У | Иле | Иле | Иле | Мет | |
А | Ц | Тре | Тре | Тре | Тре |
А | AcnNH2 | AcnNH2 | Лиз | Лиз | |
Г | Сер | Сер | Apr | Apr | |
У | Вал | Вал | Вал | Вал | |
Г | Ц | Ала | Ала | Ала | Ала |
А | Асп | Асп | Глу | Глу | |
Г | Гли | Гли | Гли | Гли | |
Примечания. Кодоны и-РНК для аминокислот, известные | |||||
к 1968 г. Названия аминокислот даны в общепринятых сокращениях. | |||||
* Триплеты, которые не кодируют ни одну из аминокислот. |
У нескольких триплетов, кодирующих одну и ту же аминокислоту, два основания, как правило, общие, а третье может различаться, но чаще принадлежит той же группе (пуриновое или пиримидиновое). Кроме того, показано, что триплеты УАА, УАГ и УГА представляют собой «нонсенсы», т. е. не кодируют ни одну из аминокислот (по крайней мере для бактерий и фагов).
К настоящему времени проблема генетического кода уже почти решена, но на ее пути еще много трудностей.
В последнее время сделано открытие, имеющее большое общебиологическое значение: установлена известная универсальность кода. Показано, что одинаковые триплеты кодируют
277
одинаковые аминокислоты в бесклеточных системах, полученных из различных организмов (бактерии, клетки млекопитающих). Код оказался универсальным для вирусов, водорослей и морского ежа. Очевидно, код является одним из старых и консервативных филогенетических механизмов.
Открытие генетического кода и синтеза белка in vitro поставило совершенно по-новому в науке вопрос о единстве живой природы. Это открытие представляет собой серьезный шаг на пути к овладению искусственным синтезом белка и тем самым к более глубокому познанию сущности живой материи.
Итак, ДНК — носитель наследственной информации в клетке. Реализация информации в онтогенезе происходит постоянно, но синтез и-РНК приурочен к определенному моменту в митотиче-ском цикле: к интерфазе, когда хромосомы находятся в де-спирализованном состоянии. Этот процесс удобно наблюдать в ооцитах на хромосомах типа «ламповых щеток», на гигантских хромосомах двукрылых при появлении деспирализованных участков — пуфов. Перенос наследственной информации от одного поколения к другому осуществляется ДНК в процессе деления клеток. В этом случае хромосомы находятся в состоянии плотной спирализации.
Однако было бы неправильно считать, что ДНК всемогуща. Ее репликация (удвоение) возможна лишь в клетке, где существуют ферменты, нуклеотиды и обязательно ДНК для затравки, так как ей свойствен матричный механизм воспроизведения. Функционирование ДНК (синтез и-РНК) также возможно при наличии белков (ферментов) и исходных продуктов.
Специальными экспериментами показано, что в клетке существуют гены, регулирующие скорость синтеза и самую возможность синтеза специфических белков-ферментов, т. е. в конечном итоге регулирующие функционирование ДНК. Но этот вопрос находится еще в стадии исследования.
* *
Итак, наследственная информация закодирована в последо
вательности нуклеотидов в молекуле ДНК и определяет после
довательность аминокислот в полипептидной цепи. Синтез белка
происходит в рибосомах без непосредственного участия ДНК.
Информацию от ДНК к белку несет и-РНК (первый продукт
гена). - -
Глава 17. ПРИРОДА ГЕНА
Существование гена как дискретной единицы наследственности было постулировано Менделем. Морган, показал, что гены связаны с хромосомами. С помощью классических методов генетического анализа были установлены следующие свойства гена.
Ген имеет основные свойства хромосом: способность к редупликации—самовоспроизведению, сохранению относительного постоянства и к закономерному распределению в митозе и мейозе.
Ген занимает определенный участок (локус) хромосомы и является предельной единицей рекомбинации, не разделяемой далее посредством кроссинговера.
Ген мутирует как единое целое и представляет собой единицу наследственной изменчивости — мутации.
Ген функционирует как целая единица и определяет один элементарный признак в организме, клетке.
Указанное представление о гене как единице рекомбинации, мутирования и функции на раннем этапе существования генетики оказало положительное влияние на дальнейшее ее развитие. Позднее выяснилось, что ген является значительно более сложной единицей наследственности и изменчивости, чем это считалось раньше. Анализу современного представления о гене посвящается эта глава.
Дата добавления: 2020-01-07; просмотров: 383; Мы поможем в написании вашей работы! |
Мы поможем в написании ваших работ!