Тактические приемы», используемые вирусами при экспрессии геномов.
Ø Транскрипционный уровень
v Синтез субгеномной РНК
v «Кража» КЭП структур
Ø Посттранскрипционный уровень
v Альтернативный сплайсинг
v Редактирование мРНК (встраивание отдельных нуклеотидов с сдвигом рамки считывания)
Ø Трансляционный уровень
v Сдвиг рамки считывания(frameshifting) (смещение на 1 нуклеотид)
v Протечка при сканировании (leakyscanning) (проскок AUG кодона, села на следующий AUG => другой белок)
v Терминация с последующей репликацией (малая субъединица рибосомы после стоп кодона остается и движется до AUG кодона)
v Супрессия стоп кодона
v Внутренняя инициация трансляции (IRES)
v Рибосомальный пропуск (ribosomalskip)
v Рибосомальное шунтирование
Ø Посттрансляционный уровень
v Разрез полипротеина
«Кража» КЭПа
Для различных клеток характерен свой КЭП. В процессе жизненного цикла отрезается КЭП у мРНК хозяина и дальше синтез (+) копии идет с использование КЭПа.
4. Общие принципы структурной организации вирусных капсидов. Виды симметрии капсидов. Функции капсидной оболочки. Примеры вирусов с различными капсидами.
По типу симметрии капсида выделяют вирусы с:
Ø Спиральным типом симметрии (Палочковидные).
Ø Икосаэдральным (квазисферический или кубический) типом симметрии (Сферические).
Ø Смешанным типом симметрии.
Функции капсидной оболочки:
Ø Защитная (защита генома от РНКаз, физических факторов и т.д.),
Ø Рецепторная (при адсорбции и проникновении),
|
|
|
Ø Структурная оболочка(структурные белки(капсомеры)) учувствует в самосборке вируса и упаковке генома внутрь капсида)
Примеры вирусов с различными капсидами:
Икосаэдрические капсиды (ИК) с Т=1
Состоят из 12 пентонов, N=60.
Примеры:
1) оцДНК:Parvoviridae, Circoviridae
2) дцРНК: Chrysoviridae
3) оцРНК(+):Astroviridae
Parvoviridae
Капсид d=20-26 нм
СР – coatprotein (смесьVP2, VP1, [VP3])
ИК с Т=3
Состоит из 12 пентонов и 20 гексонов, N=180.
Примеры:
1) dsRNA: Picobirnaviridae
2) ssRNA(+): Flaviviridae, Caliciviridae
Flaviviridae (YFV, HCV)
d=50 нм
C – капсидный белок
ИК с Т=4
Состоит из 12 пентонов, 30 гексонов, N=240
Пример:
1) ssRNA(+): Togaviridae, Tetraviridae
2) dsDNA(RT); Hepadnaviridae
Togaviridae (RUBV)
CP – процессируется от полипротеина (сгРНК) либо самостоятельно (род Alphavirus), либо клеточной сигналазой (род Rubivirus)
dвириона = 60нм, dкапсида=40нм
ИК с Т=7
Состоит из 12 пентонов, 60 гексонов, N=420
Примеры:
1) dsDNA: Papillomaviridae, Polyomaviridae
2) dsDNA(RT): Caulimoviridae
Caulimoviridae
d=50 нм
СP – capsid protein (ORF 4)
ИКсТ=13
Состоит из 12 пентонов, 120 гексонов, N=780
Примеры:
1) dsRNA: Birnaviridae, Cystoviridae, Reoviridae
Birnaviridae (DXV)
d=70нм, 260 тримеров VP2 (N=780)
C – концевые пептиды VP2 and часть МЗ1 – минорные компоненты вириона, VP3 связывается с дцРНК
ИК с Т=16
Состоят из 12 пентонов, 150 гексонов, N=960.
Пример:
|
|
|
1)дцДНК: Herpesviridae
Herpesviridae (HSV, EBV, HHV-8)
D= 150-200нм
HCV: более 30 белков оболочки, примерно 8 белков капсида (VP5 – основной белок капсида)
ИК с Т=21
Состоят из 12 пентонов, 200 гексонов, N=1260.
Примеры:
1) dsDNA: Corticoviridae
Corticoviridae (фаг РМ2)
d=56 нм, 1200 Р1 (капсидный белок), 60 Р2(пентамерные шипы)
Внутренний фосфолипидный слой содержит структурные белки Р3-Р9
ИК с Т=25
Состоят из 12 пентонов, 240 гексонов, N=1500
Пример:
1) dsDNA: Adenoviridae, Tectiviridae
Adenoviridae
d=70-100нм, 11 белков капсида
pII – основной белок капсида (гексон сформирован триммеров pII), pVI, pVIII, pIX – стабилизируют гексон
5 копий pVIII формируют основание пентона, pIV формирует триммер фибриллы
pIIIa связывает гексоны, окружающие пентоны с pVII кора
pVII – основной белок кора, pVandmu – минорные компоненты TP
Спиральный тип симметрии
В нуклеокапсиде взаимодействие нуклеиновой кислоты и белка осуществляется по одной оси вращения. Каждый вирус со спиральной симметрией обладает характерной длиной, шириной и периодичностью нуклеокапсида (сколько капсомеров приходится на виток).
Организация по принципу спиральной симметрии придаёт вирусам палочковидную форму. При спиральной симметрии белковый чехол лучше защищает наследственную информацию, но требует большого количества белка, так как покрытие состоит из сравнительно крупных блоков.
|
|
|
Пример: TMV
Ø 2130 субъединиц СР
Ø L=3000нм,
Ø r=9 нм
Ø 
капсомера (СР) на 1 виток
Ø Шаг спирали 2,3 нм
CP: 158 а/к, на 1 субъединицу приходится 3 основания РНК.
Пример:Filoviridae, (-)одРНК: Ebolavirus (ZEBOV), Marbyrgvirus(MARV)
Ø L=1400нм,
Ø r=25нм
Ø Шаг спирали 5нм
Ø NP – основной белок нуклеокапсида, VP30 – минорный белок нуклеокапсида, 5 структурных белков заякорены во внешней мембране
Пример:Paramyxoviridae, ssRNA(-): Paramyxovirinae (HPIV-1, MuV, MEV), Pneumovirinae
Пример: Orthomyxoviridae, ssRNA(-)
d=80-120нм, встречается нитевидной формы
Гемагглютинин (НА) и нейроминидаза (NA)
В отличие от пармиксовирусов ТЗ не защищает РНК от рибонуклеаз
Пример: Rabdoviridae, ssRNA(-): VSIV, RABV
L=180нм, w=75нм
5. Принцип строения ИК. Ассиметричная ячейка. Капсомеры. Число Т. Примеры вирусов с ИК (смотри предыдущий вопрос!).
Дата добавления: 2018-06-01; просмотров: 1614; Мы поможем в написании вашей работы! |
Мы поможем в написании ваших работ!