Идентификация бактерий по Д. Берги (D. Bergey)
Санкт-Петербургский государственный университет
Медицинский факультет
Кафедра физиологии
Методическое пособие для подготовки к экзамену по медицинской микробиологии, иммунологии и вирусологии(по мотивам лекций д.б.н., проф. О.В. Рыбальченко).
Выполнил
Студент 2 курса 206 группы
Агалаков И.Д
Дополнил
Студент 2 курса 208 группы
Корнилов Р.Н.
Издани е 1-е
Санкт-Петербург
2012
Предисловие.Данное пособие представляет собой всю имеющуюся у меня информацию структурированную в соответствии с экзаменационными вопросами. Большое спасибо Пойде Михаилу и Ковалевич Виктории за предоставленную информацию. Прошу прошения за большое количество неточностей и опечаток, т.к. сам еще это не читал.
ВОПРОСЫ К ЭКЗАМЕНУ(Старые, смотри сайт)
по МЕДИЦИНСКОЙ МИКРОБИОЛОГИИ, иммунологии и вирусологии
для студентов __2___ курса 2011/12 учебного года,
специальность ЛЕЧЕБНОЕ ДЕЛО
1. Предмет изучения микробиологии
2. Значение размерности в микробиологии
3. Клеточные и неклеточные формы жизни, разделы микробиологии по объектам
4. Возникновение и ранние этапы развития микробиологии
5. Развитие бактериологии в конце XIX в., великие микробиологи
|
|
|
6. Распространение бактерий
7. Функциональная роль бактерий
8. Три источника энергии бактерий
9. Значение бактерий в эволюции жизни на Земле
10. Роль бактерий в жизни человека
11. Особенности организации прокариотической клетки, теория существования прокариот
12. Классические критерии систематизации прокариот
13. Главный современный критерий систематизации прокариот
14. Три домена живой природы
15. Строение цитоплазматической мембраны (ЦПМ)
16. Функции цитоплазматической мембраны (ЦПМ)
17. Регуляция осмотического давления
18. Энергетическая функция
19. Транспортная функция
20. Сенсорная функция
21. Строение пептидогликана клеточной стенки
22. Особенности строения и синтез пептидной части пептидогликана
23. Пенициллин и его действие на пептидогликан
24. Действие лизоцима и литических ферментов на пептидогликан
25. Функции пептидогликана
26. Метод окраски по Граму
27. Особенности строения клеточной стенки фирмикутных бактерий
28. Особенности строения клеточной стенки микобактерий
29. Особенности строения клеточной стенки грациликутных бактерий
30. Белки внешней мембраны клеточной стенки грациликутных бактерий
|
|
|
31. L-формы бактерий, L-трансформация
32. Протопласты, сферопласты
33. Бактериальная капсула
34. Адсорбция и адгезия бактерий
35. Понятие колонизации у бактерий
36. Бактериальные фимбрии
37. Классификация фимбрий
38. Движение бактерий, типы движения
39. Типы жгутикования
40. Строение жгутиков
41. Работа жгутиков
42. Различные таксисы бактерий
43. Бактериальная цитоплазма
44. Включения цитоплазмы
45. Строение бактериального генома: хромосомы
46. Плазмиды
47. Три способа передачи генетической информации: конъюгация, трансформация, трансдукция
48. Размножение бактерий
49. Способы выращивания бактерий
50. Покоящиеся формы бактерий, эндоспоры
51. Регуляция образования покоящихся форм бактерий
52. Эндоспоры
53. Система глобальной регуляции QS-система (Quorum Sensing System)
54. Гетерогенность микробных популяций
55. Особенности организации микробных сообществ
56. Нормальная микрофлора. Возрастные, географические, социальные особенности.
57. Представители нормальной микрофлоры кишечника
58. Положительное значение нормальной микрофлоры.
59. Возможная отрицательная роль нормальной микрофлоры.
60. Положительные функции нормальной микрофлоры.
61. Иммунологическая толерантность к собственной микрофлоре.
|
|
|
56 Молочнокислые бактерии
62. Механизмы антимикробного действия молочнокислых бактерий.
63. Дисбактериоз. Причины. Диагностика. Профилактика и лечение.
64. Классификация пробиотических препаратов: про-, пре-, синбиотики.
65. Микроорганизмы, использующиеся для создания пробиотических препаратов.
66. Показания для использования про-, пре-, синбиотиков и возможные осложнения при их введении в организм человека.
67. Задачи клинической микробиологии
68. Методы клинической микробиологии
69. Возбудители и причины госпитальных инфекций
70. Возбудители стафилококковых инфекций
71. Возбудители стрептококковых инфекций
72. Пневмококки
73. Возбудитель гонореи
74. Возбудитель менингококковой инфекции
75. Возбудители эшерихиозов
76. Возбудители дизентерии
77. Возбудители брюшного тифа и паратифов
78. Возбудители кишечного иерсиниоза и псевдотуберкулеза
79. Возбудитель чумы
80. Возбудители бруцеллеза
81. Возбудитель туляремии
82. Возбудитель сибирской язвы
83. Бактерии рода Bacillus
84. Бактерии семейства Vibrionaceae
85. Возбудитель холеры
86. Бактерии рода Campylobacter
87. Бактерии рода Helicobacter
88. Возбудитель дифтерии
89. Возбудители коклюша и паракоклюша
90. Возбудитель эпидемичесого возвратного тифа
|
|
|
91. Возбудители эндемического возвратного тифа
92. Возбудители спирохетозов
93. Возбудитель сифилиса
94. Возбудитель болезни Лайма
95. Возбудитель лептоспироза
96. Возбудители группы сыпного тифа
97. Возбудители группы клещевых лихорадок
98. Возбудитель Ку-лихорадки
99. Возбудитель группы цуцугамуши
100. Бактерии рода Chlamydia и Chlamydophila
101. Возбудители протозойных инфекций
102. Возбудители протозойных кишечных инфекций
103. Возбудители кровяных протозойных инфекции
104. Возбудитель трихомониаза
105. Возбудители анаэробных инфекций
106. Возбудитель ботулизма
107. Возбудитель столбняка
108. Возбудители микобактериозов
109. Возбудители туберкулеза
110. Возбудители микозов
111. Возбудители кандидоза
112. Возбудители аспергиллеза
113. Возбудители актиномикозов
114. Бактерии рода Legionella
115. Микоплазмы
116. История открытия бактериофагов
117. Особенности строения и биологии бактериофагов
118. Стадии инфекционного процесса у бактериофагов
119. Строение Т-четного бактериофага
120. Строение фага лямбда
121. История открытия, основные принципы организации вирусов
122. Отличие вирусов от бактерий и других организмов
123. Разнообразие строения вирусов
124. Классификация вирусов
125. Вирусы человека и животных
126. Типы вирусных инфекций
127. Вирус гриппа
128. Парамиксовирусы
129. Вирус эпидемического паротита
130. Вирус кори
131. Семейство Coronaviridae
132. Семейство Adenoviridae
133. Энтеровирусы
134. Вирус полиомиелита
135. Вирус Коксаки
136. Вирус ЕСНО
137. Ротавирусы
138. Вирусные гепатиты
139. Вирус гепатита В
140. Вирус гепатита С
141. Вирус гепатита G и D (дельтавирус)
142. Вирус гепатита А
143. Вирус гепатита Е
144. Семейство Herpesviridae
145. Вирус простого герпеса
146. Вирус ветряной оспы
147. Цитомегаловирус человека
148. Вирус Саркомы Капоши
149. Вирус Эпштейна-Барр
150. Тогавирусы Род Rubivirus
151. Род Flavivirus
152. Флавивирусные лихорадки
153. Флавивирусные энцефалиты
154. Picornaviridae
155. Род Poliovirus
156. Возбудитель ящура
157. Род Lyssovirus
158. Семейство Filoviridae
159. Простые ретровирусы
160. Строение вириона ВИЧ
161. Организация генома ВИЧ
162. ВИЧ-инфекция и СПИД
163. Семейство Papovaviridae
164. Вирус натуральной оспы
165. Прионы
Вопрос 1. Предмет микробиологии
Микробиология – наука о мельчайших живых существах- микроорганизмах.
Микроорганизмы – живые организмы, невидимые невооруженным глазом.
Объекты изучения микробиологии: бактерии, грибы, простейшие, вирусы - не видны без специальных оптических приборов
Вопрос 2. Значение размерности в микробиологии
Глаз человека – своеобразный оптический прибор (РС- 200 мкм). РС – наименьшее расстояние, при котором две точки видны раздельно.
Размеры микроорганизмов измеряют в мкм и нм. Ср.длина бактерии – 1,5-2 мкм. Фага – 300 нм. Простейшего – 10-100 мкм.
Соотношение величин длины микроорганизмов: 1 мм = 1000 мкм 1мкм = 1000 нм = 10000Å 1мм = 103 мкм 1мм = 106 нм 1нм = 10 Å
Для увеличения микроскопических объектов существуют световой, электронный и др. микроскопы. РС светового микроскопа – 0,2 мкм. РС электронного микроскопа –2Å. Размеры отражают свойства МО
Разные размеры → разное строение → разные свойства
Неклеточное строение – вирусы (самые мелкие)
Клеточное строение – прокариоты – бактерии (более крупные)
Клеточное строение –эукариоты – грибы, простейшие (самые крупные)
Вопрос 3. Разделы микробиологии по объектам – прокариоты и эукариоты, клеточные и неклеточные формы жизни
I.- эукариоты:
1.простейшие – наука протистология (протозоология),
2.водоросли – наука альгология,
3.микроскопические грибы – наука микология
II. – прокариоты:1.бактерии, 2. цианобактерии, 3. археи – наука бактериология
III.- вирусы – наука вирусология
Прокариоты
Прокариоты не имеют мембранных органелл (ядра, митохондрий, АГ, ЭПС).
Клетка прокариот не может быть меньше 0,05 мкм (50 нм), т.к. диаметр рибосомы – 20 нм.
Археи – обитатели экстремальных зон. Неинфекционные микроорганизмы, не вызывают патологических состояний, могут быть симбионтами
Вопрос 4 .Возникновение и ранние этапы развития микробиологии.
1. Антуан ван Левенгук (1632-1723) – первые сведения о микроорганизмах
2. Мюллер Отто Фредерик (1730-1784) - Род Monas, Род Vibrio, Род Proteus
3. Д.С.Самойлович (1744-1805 - убежденный сторонник гипотезы о живой природе возбудителя чумы. За сто с лишним лет до открытия микроорганизма пытался обнаружить его
Идея о возможности создания искусственного иммунитета против чумы с помощью прививок (1771г.)
4. Эдвард Дженнер - 1796г. Первая вакцина от оспы
По предложению Луи Пастера в память о дженнеровской прививке все прививочные материалы называют вакцинами — от латинского слова “vacca” — “корова”
5.Фердинанд Кон (1828-1898) - ввел термин "бактерия", автор трудов по морфологии, истории развития и систематике водорослей и грибов, отнес бактерии к растениям.
Вопрос 5. Развитие микробиологии в конце XIX и в начале XX вв.
Первые великие микробиологи:
Луи Пастер (1822 – 1895)
1857 г. – процесс брожения, принцип специфичности по получаемому продукту.
1860 г. – самопроизвольное зарождение жизни.
1865 г.- болезни пива и вина.
1868 г. – болезни шелковичных червей.
1881 г. – разработка вакцин.
1885 г. – 1-я прививка от бешенства (вирус рода Lyssovirus).
Опыты Л. Пастера по исследованию самопроизвольного зарождения жизни (1860г).
Роберт Кох (1843-1910).
1870 г. – создание сред для получения чистых культур
1876 г. – возбудитель сибирской язвы Bacillus anthracis
1877 г. – анилиновые красители
1878 г. – триада Коха
1882 г. - возбудитель туберкулеза Mycobacterium tuberculosis
1883-1884 гг. – возбудитель холеры Vibrio cholerae
1895 – Нобелевская премия!
Триада Коха (1878 г.): Для этиологического доказательства возбудителя заболевания нужно:
1. обнаружить МО
2. выделить и получить чистую культуру
3.воспроизвести заболевание на животных
Джозеф Листер (1827-1912) Английский врач хирург, Основатель теории антисептики
Пауль Эрлих (1854 – 1915). Немецкий фармаколог и иммунолог, первые открытия в области химиотерапии
Отечественные микробиологи, получившие мировое признание
Сергей Николаевич Виноградский (1856-1953). Основатель почвенной микробиологии: Теория хемосинтеза
Николай Федорович Гамалея (1859-1949). Создатель бактериологических станций в России, станции прививок против бешенства
Илья Ильич Мечников (1845 -1915). Создатель фагоцитарной теории иммунитета. нобелевская премия 1908 г.
Вопрос 6. Распространение бактерий
МО составляют существенную долю живого вещества на планете: 0,2% от общего количества видов живых организмов.
Описано 5 тыс. видов бактерий – это 5-6% от всех бактерий
В действительности - около 5 млн. видов МО (для сравнения, известен 1 млн. видов насекомых)
Бактерии обитают повсеместно. Подземное царство: Пещеры (несколько км вглубь до уровня 100 ºС, предел +113 ºС – термофилы). Почва. Почвенные воды. Реки. Воздух. Все живые организмы
VBNC –некультивируемые формы (покоящиеся) МО – нанобактерии: V- viable, B- but, N- not, C -culturable, известно 15 тыс. фантомных генотипов некультивируемых форм (нанобактерий)
Биоразнообразие бактерий. Различная форма, размеры: 0,2 мкм - самые мелкие. 1 мм - самые крупные. 1-2 мкм - средние размеры. 10 -12 г – вес одной бактерии
Вопрос 7. Функциональная роль бактерий
Бактерии ограничены в получении энергии и субстратов.Если обеспечить бактериям доступ питательных веществ, отвод продуктов метаболизма, то через 1 сутки они достигнут массы планеты (расчет по углероду).
Для нормального существования биосферы необходима постоянная репродукция бактерий.
1) Бактерии - живые катализаторы, высокая ферментативная активность, редуценты.
2) Способны аккумулировать из внешней среды и передавать другим организмам: N, Р, С.
3) Круговорот веществ в природе.
Вопрос 8. Три источника энергии бактерий
По типу питания бактерии разделяют на две группы: автотрофы и гетеротрофы
Автотрофы:
1. Энергия солнечного света (фототрофы - усваивают СО2 )
2. Энергия химических связей(хемотрофы –окисление неорганических веществ, литотрофы)
Гетеротрофы
3. Энергия химических связей (органотрофы – расщепление органических веществ)
Вопрос 9. Роль бактерий в эволюции жизни на Земле
Земле 4,5 млрд. лет. 4 млрд. лет - цианобактерии (СЗВ).
Гибридные бактерии (слияние ядерной клетки и пурпурных бактерий → митохондрии).
Специализированные клетки → сообщества клеток → Многоклеточный организм → Специализация → тканевой организм → Органная структура
Вопрос 10. Значение бактерий в жизни человека
Негативная роль:
1. возбудители заболеваний
2. бактериальная коррозия
3. выделение токсинов
Позитивная роль:
1. бактерии - редуценты (круговорот веществ в природе, почва)
2. бактерии – симбионты
3. использование в биотехнологии
Вопрос 11. Теория существования прокариот
Согласно клеточной теории Т. ШВАННА и М. ШЛЕЙДЕНА (1839) в каждой клетке должно быть ядро. В клетках большинства микроорганизмов ядра не обнаруживали. Считали, что вся клетка микроорганизма – это большое ядро, а по краям - тонкая прослойка цитоплазмы. К какой группе живых организмов их отнести? Получалось, что клеточная теория на них не распространяется.
Формирование теории существования прокариот.
1925– введен термин прокариоты (рrokaryota) для объединения различных форм неядерных микроорганизмов.
1962 г. Создатели теории существования прокариот: Р. Стейннер и К. Ван Ниль: у прокариот нет специального компартмента для хранения генетического материала, т.е. ядра.
Микроорганизмы, имеющие клеточное строение, разделены на 2 группы - две ветви эволюционного дерева (дихотомическое ветвление).
1. прокариоты (нет ядра, есть нуклеоид)
2. эукариоты (есть ядро)
Вопрос 12. Классические критерии систематизации прокариот
Критериисравнительно-морфологического подхода:
1.Морфологические свойства: форма и размеры бактерий (кокки, палочки, вибрионы, извитые формы).
2. Характер взаимного расположения клеток (диплококки, цепочки, группы, пакеты, хаотично).
К концу XIX века потребовались новые критерии:
3. Биохимические свойства.
4. Физиологические свойства.
Идентификация бактерий по Д. Берги (D. Bergey)
1923 - новый определитель бактерий Д. Берги. Дано точное описание бактерий и порядок проведения исследований для их идентификации. К настоящему времени вышло 9 выпусков определителя Д. Берги
В 1948 г. - номенклатурный кодекс бактерий, в основе - бинарная номенклатура Карла Линнея (1707-1778 «Система природы»).
Но и в последнем определителе не содержится ключей для определения филогенетического, т.е. эволюционного родства бактерий!!!
Вопрос 13. Главный современный критерий систематизации прокариот
Главный критерий, определяющий таксономическое положение бактерий - эволюционное родство. Источник информации об эволюционном происхождении бактерий - последовательность нуклеотидов в 16S рРНК – малой субъединице рибосомы бактерий.
Молекулярный маркер предложен Карлом Возом (K. Woese).
Бактериальная рибосома 70S.
Состоит из малой субъединицы 30S и большой субъединицы 50S.
Включает 55 белков и 3 разновидности рРНК: 5S, 16S, 23S.
Из них К. Воз выбрал участки рРНК наиболее оптимальной длины: 16S рРНК =~1500 нуклеотидов (не очень большой и не очень короткий). В ней жеcткие консервативные участки перемежаются с вариабельными.
Сравнивая количество несоответствий, высчитывают коэффициент соответствия и строят диаграмму.
Экстремафильные прокариоты.
К. Воз : - создал базы данных для бактерий и экстремафилов:
1. термофильные бактерии – при высоких температурах,
2. психрофильные бактерии –при низких температурах,
3. галофильные бактерии – при высоким содержании NaCl,
4. ацидофильные бактерии – при низких значениях рН.
- отметил, что у микроорганизмов, обитающих в экстремальных условиях, очень незначительное родство с большинством бактерий.
- предложилвыделить экстремафильных прокариот в отдельную группу и ввести термин «археи»
Таким образомэволюционное деревоиз дихотомического стало трихотомическим.
Вопрос1 4. Три домена живой природы
3 основные эволюционные ветви назвали доменами: 1) археи, 2) эубактерии, 3) эукариоты.
Дата добавления: 2018-04-04; просмотров: 1047; Мы поможем в написании вашей работы! |
Мы поможем в написании ваших работ!