Состав микрофлоры основных биотопов человека



Методические рекомендации

              Анаэробная инфекция

   Этиология, патогенез, антибактериальная терапия.

Содержание:

 Предисловие...................................................................................... 1

Введение............................................................................................. 2

1.1 Определение и характеристика.................................................. 2

1.2 Состав микрофлоры основных биотопов человека................. 5

2. Факторы патогенности анаэробных микроорганизмов......... 6

2.1. Роль анаэробной эндогенной микрофлоры в патологии

человека...................................................................................………. 8

3. Основные формы анаэробной инфекции....................………...... 10

3.1. Плевролегочная инфекция......................................................…..           10

3.2. Диабетическая инфекция стопы..............................................…. 10

3.3. Бактериемия и сепсис................................................................ 11

3.4. Столбняк..................................................................................... 11

3.5. Диарея.......................................................................................... 12

3.6. Хирургическая инфекция ран и мягких тканей....................... 12

3.7. Газообразующая инфекция мягких тканей............................. 12

3.8. Клостридиалъный мионекроз................................................... 12

3.9. Медленно развивающаяся некротическая раневая инфекция…13

3.10. Внутрибрюшинная инфекция...............................…………….. 13

3.11. Характеристика экспериментальных анаэробных абсцессов.....13

3.12. Псевдомембранозный колит..........................................................14

3.13. Акушерско-гинекологическая инфекция......................................14

3.14. Анаэробная инфекция у онкологических больных……………..15

4. Лабораторная диагностика..............................................................15

4.1. Исследуемый материал.....................................................................15

4.2. Этапы исследования материала в лаборатории..............................16

4.3. Прямое исследование материала......................................................16

4.4. Способы и системы для создания анаэробных условий.................16

4.5. Питательные среды и культивирование...........................................17

5. Антибиотикотерапия анаэробной инфекции................................. 21

5.1. Характеристика основных антимикробных препаратов,

используемых при лечении анаэробной инфекции..........................….21

5.2. Комбинация бэта-лактамных препаратов и ингибиторов

  бэта-лактамазы...................................................................................24

5.3. Клиническое значение определения чувствительности анаэробных

   микроорганизмов к антимикробным препаратам.......…………...24

6. Коррекция микрофлоры кишечника.......................……………….26

7. Заключение..........................................................................................27

8. Авторы……………………………………………………………….27

 

Предисловие

Последние годы характеризуются ускоренным развитием многих на­правлений общей и клинической микробиологии, что обусловлено, ве­роятно, как более адекватным пониманием нами роли микроорганизмов в развитии заболеваний, так и необходимостью врачей постоянно поль­зоваться информацией об этиологии заболеваний, свойствах возбудите­лей с целью успешного ведения пациентов и получения удовлетвори­тельных конечных результатов химиотерапии или химиопрофилактики. Одним из таких бурно развивающихся направлений микробиологии яв­ляется клиническая анаэробная бактериология. Во многих странах мира данному разделу микробиологии уделяется существенное внимание. Разделы, посвященные анаэробам и анаэробным инфекциям, включают­ся в программы подготовки врачей различных специальностей. К сожа­лению, в нашей стране данному разделу микробиологии как в плане подготовки специалистов, так и в диагностическом аспекте работы бак­териологических лабораторий уделялось недостаточное внимание. Ме­тодическое пособие «Анаэробная инфекция» охватывает основные раз­делы данной проблемы - определение и классификацию, характеристику анаэробных микроорганизмов, главные биотопы анаэробов в организме, характеристику форм анаэробной инфекции, направления и методы ла­бораторной диагностики, а так же комплексно- антибактериальную те­рапию (антимикробные препараты, устойчивость\чувствительность микроорганизмов, методы ее определения и преодоления). Естественно, что методическое пособие не ставит цели дать подробные ответы на все аспекты анаэробной инфекции. Вполне понятно, что микробиологам, желающим работать в области анаэробной бактериологии, необходимо пройти специальный цикл обучения, более полно освоить вопросы мик­робиологии, лабораторной техники, методы индикации, культивирова­ния и идентификации анаэробов. Кроме того, хороший опыт приобрета­ется во время участия в специальных семинарах и симпозиумах, посвя­щенных анаэробной инфекции, на национальном и международном уровнях. Данные методические рекомендации адресованы специалистам бактериологам, врачам разных специальностей (хирургам, терапевтам, эндокринологам, акушер-гинекологам, педиатрам), студентам медицин­ских и биологических факультетов, преподавателям медвузов и медучи­лищ.

Введение

Первые представления о роли анаэробных микроорганизмов в пато­логии человека появились многие столетия тому назад. Еще в 4 веке до нашей эры Гиппократ подробно описал клинику столбняка, а в 4 веке нашей эры Ксенофон описал случаи острого некротизирующего язвен­ного гингивита у греческих солдат. Клиническая картина актиномикозов была описана Лангенбеком в 1845 году. Однако в то время не было яс­но, какие микроорганизмы вызывают эти заболевания, каковы их свой­ства, равно как и концепция анаэробиоза отсутствовала до 1861 года, когда Луи Пастер опубликовал классическую работу по изучению Vibrio butyrigue и назвал организмы, живущие в отсутствие воздуха, «анаэро­бами» (17). В последующем Луи Пастер (1877) выделил и культивиро­вал Clostridium septicum, а Israelв 1878 описал актиномицеты. Возбу­дитель столбняка - Clostridium tetani - выявлен в 1883 году Н. Д. Мона­стырским, а в 1884 году А. Николайером. Первые исследования больных с клинической анаэробной инфекцией были выполнены Леви в 1891 го­ду. Более полно роль анаэробов в развитии разнообразной медицинской патологии была впервые описана и аргументирована Veiloonи Zuberв 1893-1898 годах. Они описали различные типы тяжелых инфекций, вы­зываемых анаэробными микроорганизмами (гангрену легкого, аппенди­цит, абсцессы легкого, мозга, таза, менингит, мастоидит, хронический отит, бактериемию, параметрит, бартолинит, гнойный артрит). Кроме того, они разработали многие методические подходы к изоляции и куль­тивированию анаэробов (14). Таким образом, к началу XX века стали известны многие из анаэробных микроорганизмов, сформировалось представление об их клинической значимости, была создана соответст­вующая техника культивирования и выделения анаэробных микроорга­низмов. Начиная с 60-х годов и по настоящее время актуальность про­блемы анаэробных инфекций продолжает нарастать. Это обусловлено как этиологической ролью анаэробных микроорганизмов в патогенезе заболеваний, так и развитием устойчивости к широко применяемым ан­тибактериальным препаратам, а также тяжелым течением и высокой летальностью вызываемых ими заболеваний.

Определение и характеристика

В клинической микробиологии микроорганизмы принято классифицировать на основе их отношения к кислороду воздуха и двуокиси углерода. В этом легко убедиться при инкубации микроорганизмов на кровяном агаре в различ­ных условиях: а) в обычной воздушной среде (21% кислорода); б) в условиях СО2 инкубатора (15% кислорода); в) в микроаэрофильных условиях (5% ки­слорода) г) анаэробных условиях (0% кислорода). Используя этот подход бак­терии могут быть разделены на 6 групп: облигатные аэробы, микроаэрофильные аэробы, факультативные анаэробы, аэротолерантные анаэробы, микроаэротолерантные анаэробы, облигатные анаэробы. Данная информация полезна для первичной идентификации как аэробов, так и анаэробов.

Аэробы. Для роста и размножения облигатные аэробы нуждаются в ат­мосфере, содержащей молекулярный кислород в концентрации 15-21% или в СО; инкубаторе. Микобактерии, холерный вибрион и некоторые грибы явля­ются примером облигатных аэробов. Эти микроорганизмы большую часть своей энергии получают путем процесса дыхания.

Микроаэрофилы (микроаэрофильные аэробы). Они также нужда­ются в кислороде для размножения, но в концентрациях ниже, чем он присут­ствует в комнатной атмосфере. Гонококки и кампилобактерии являются примером микроаэрофильных бактерий и предпочитают атмосферу с содержани­ем О2 около 5%.

Микроаэрофильные анаэробы. Бактерии, способные расти в анаэробных и микроаэрофильных условиях, но неспособные расти в СО2 инкубаторе или воздушной среде.

Анаэробы. Анаэробами называются микроорганизмы, для жизни и размножения которых кислород не нужен. Облигатные анаэробы- бактерии, которые растут только в анаэробных условиях, т.е. в безкислородной атмосфе­ре.

Аэротолерантные микроорганизмы. Способны расти в атмосфере, содержащей молекулярный кислород (воздух, СO2 инкубатор), но лучше они растут в анаэробных условиях.

Факультативные анаэробы (факультативные аэробы). Способны выживать в присутствии или отсутствии кислорода. Многие бактерии, выделяемые от больных, являются факультативными анаэробами (энтеробактерии, стрептококки, стафилококки).

Капнофилы. Ряд бактерий, лучше растущих в присутствии повышен­ных концентраций СО2, названы капнофилами, или капнофильными организ­мами. Бактероиды, фузобактерии, гемоглобинофильные бактерии относятся к капнофилам, так как они лучше растут в атмосфере, содержащей 3-5% СО2 (2,

19,21,26,27,32,36).

Основные группы анаэробных микроорганизмов представлены в таблице 1. (42, 43,44).

Таблица I . Наиболее значимые анаэробные микроорганизмы

Род

Виды

Краткая характеристика

Bacteroides

В . fragilis

В . vulgatus

В . distansonis

В . eggerthii

 

Грамотрицательные., спор не образующие палочки

 

Prevotella

P. melaninogenicus

P. bivia

P. buccalis

P. denticola

P. intermedia

 

Грамотрицательные, спор не образующие палочки

 

 
Porphyromonas

P. asaccharolyticum

P. endodontalis

P. gingivalis

 

Грамотрицательные, спор не образующие палочки

 

Ctostridium

C. perfringens

C. ramosum

C. septicum

C. novyi

C. sporogenes

C. sordelii

C. tetani

C. botulinum

C. difficile

 

Грамположителъные, спорообразующие палочки, или бациллы

 

Actinomyces

А . israelii

A. bovis

 

Грамположительные, не образующие спор палочки

 

Pseudoramibacter *

P . alactolyticum

 

Грамположительные, не образующие спор палочки

 

Eubacterium

 

E. lentum E. rectale E. limosum  

Грамположительные, не образующие спор палочки

 

 

Bifidobacterium

B. eriksonii B. adolescentis B. breve  

Грамположительные па­лочки

 

 

Propionobacterium

P. acnes P. avidum P. granulosum P. propionica**  

Грамположительные. не образующие спор палочки

 

 

Lactobacillus

L. catenaforme L. acidophylus  

Грамположительные па­лочки

 

 

Peptococcus

P. magnus P. saccharolyticus P. asaccharolyticus  

Грамположительные, не образующие спор кокки

 

 

Peptostreptococcus

P. anaerobius P. intermedius P. micros P. productus  

Грамположительные, не образующие спор кокки

 

 

Veilonella

V . parvula  

Грамотрицательные, не   образующие спор кокки        

 

 

Fusobacterium

F. nucleatum F. necrophorum F. varium F. mortiferum  

Веретенообразные            палочки

 

 

Campilobacter

C. fetus C.jejuni C. coli  

Грамотрицательные, тон­кие, спиралевидные, не об­разующие спор палочки

 

 
           

 

* Eubacterium alaclolyticum реклассифицированы как Pseudoramibacter alactolyticum (43,44)

** ранее Arachnia propionica (44)

*** синонимы F . pseudonecrophorum , F . necrophorum biovar С (42,44)

 

Состав микрофлоры основных биотопов человека

Этиология инфекционных заболеваний в последние десятилетия пре­терпела существенные изменения. Как хорошо известно, ранее главную опасность для здоровья человека составляли острозаразные инфекции: брюшной тиф, дизентерия, сальмонеллезы, туберкулез и многие другие, которые передавались преимущественно экзогенным путем. Хотя эти инфекции до сих пор остаются социально важными и теперь вновь по­вышается их медицинская значимость, но в целом их роль существенно снизилась. Одновременно отмечается возрастание роли условнопатогенных микроорганизмов, представителей нормальной микрофлоры ор­ганизма человека. В состав нормальной микрофлоры человека входят более 500 видов микроорганизмов. Нормальная микрофлора, обитаю­щая в человеческом организме, в значительной мере представлена ана­эробами (Таблица 2).

Анаэробные бактерии, населяющие кожу и слизистые оболочки чело­века, осуществляя микробную трансформацию субстратов экзо- и эндо­генного происхождения, продуцируют широкий спектр разнообразных ферментов, токсинов, гормонов и других биологически активных соеди­нений, которые всасываются, связываются с комплиментарными рецепто­рами и оказывают влияние на функцию клеток и органов. Знание состава специфической нормальной микрофлоры определенных анатомических областей полезно для понимания этиологии инфекционных процессов. Совокупность видов микроорганизмов, заселяющих определенную анато­мическую область, называют индигенной микрофлорой. Более того, обна­ружение специфических микроорганизмов в значительном количестве на удалении или в необычном для обитания месте лишь подчеркивает их уча­стие в развитии инфекционного процесса (11, 17,18, 38).

Дыхательный тракт. Микрофлора верхних дыхательных путей очень разнообразна и включает более 200 видов микроорганиз­мов, входящих в состав 21 рода. 90% бактерий слюны являются анаэро­бами (10, 23). Большинство из этих микроорганизмов неклассифициро­ваны современными методами таксономии и не имеют существенного значения для патологии. Дыхательные пути здоровых людей наиболее часто колонизированы следующими микроорганизмами - Streptococcus pneumonie - 25-70%; Haemophilus influenzae - 25-85%; Streptococcus pyogenes - 5-10%; Neisseria meningitidis - 5-15%. Анаэробные микроорга­низмы, такие как Fusobacterium , Bacteroides spiralis , Peptostreptococcus , Peptococcus , Veilonella и некоторые виды Actinomyces обнаружены прак­тически у всех здоровых людей. Колиформные бактерии обнаруживаются в дыхательном тракте у 3-10% здоровых людей. Повышенная колони­зация дыхательных путей данными микроорганизмами выявлена у алко­голиков, лиц с тяжелым течением болезни, у больных, получающих ан­тибактериальную терапию, угнетающую нормальную микрофлору, а также у лиц с нарушениями функций иммунной системы.

Таблица 2. Количественное содержание микроорганизмов в биотопах

организма человека в норме

 

Биотоп   Содержание (в мл или гр)   Соотношение (анаэробы / аэробы)  
Верхние дыхательные пути Отделяемое носа Слюна Поверхность языка Десневая щель     103-104 109-10'° 1010-10" 10"-1012     3-5:1 1:1               1:1           1000:1               
Желудочно-кишечный тракт Желудок Тонкий кишечник Толстый кишечник     102-105 102-107 1011-1012     1:1                 1:1 1000:1               
Женский генитальный тракт Матка Влагалище     108-109 108-109     3-5:1 3-5:1  
Кожа Поверхность Внутри фолликулов     104-105 105-106     100:1 100:1  

 

Популяции микроорганизмов в дыхательном тракте приспосаблива­ются к определенным экологическим нишам (нос, глотка, язык, десневые щели). Адаптация микроорганизмов к данным биотопам обусловли­вается аффинностью бактерий к определенным типам клеток или по­верхностей, то есть определяется клеточным или тканевым тропизмом. Например, Streptococcus salivarius хорошо прикрепляется к эпителию щеки и доминирует в составе буккальной слизистой. Прилипание бакте-

рий может объяснить и патогенез некоторых заболеваний. Streptococcus pyogenes хорошо прилипает к эпителию глотки и часто вызывает фа­рингиты, кишечная палочка аффинна к эпителию мочевого пузыря и поэтому вызывает цистит.

Кожа. Индигенная микрофлора кожи представлена бактериями преимущественно следующих родов: Staphylococcus , Micrococcus , Со rynobacterium , Propionobacterium , Brevibacterium и Acinetobacter . Также часто присутствуют дрожжи рода Pityrosporium . Анаэробы представле­ны в значительной мере грамположительными бактериями рода Propi ­ onobacterium (обычно Propionobacterium acnes ). Грамположительные кокки ( Peptostreptococcus spp .) и грамположительные бактерии рода Eubacterium присутствуют у некоторых индивидуумов.

Уретра. Бактериями, колонизирующими дистальные отделы уретры, являются стафилококки, негемолитический стрептококк, дифтероиды и в незначительном числе случаев различные представители се­мейства энтеробактерий. Анаэробы представлены в большей мере гра-мотрицательными бактериями - Bacteroides и Fusobacterium spp ..

Влагалище. Около 50% бактерий из секрета шейки матки и влагалища являются анаэробами. Большая часть анаэробов представлена лактобациллами и пептострептококками. Часто обнаруживаются прево-теллы - P . bivia и P . disiens . Кроме того, встречаются грамположитель­ные бактерии рода Mobiluncus и Clostridium .

Кишечник. Из 500 видов, населяющих организм человека, при­близительно 300 - 400 видов живут в кишечнике. В наибольшем числе в кишечнике выявляются следующие анаэробные бактерии - Bacteroides , Bifidobacterium , Clostridium , Eubacterium , Lactobacillus и Peptostrepto ­ coccus . Бактероиды являются доминирующими микроорганизмами. Ус­тановлено, что на одну клетку кишечной палочки приходится тысяча клеток бактероидов.


Дата добавления: 2019-02-12; просмотров: 462; Мы поможем в написании вашей работы!

Поделиться с друзьями:






Мы поможем в написании ваших работ!