ГЛАВА I. Предмет, краткая история и основные положения генетики

Ленинградский государственный университет

имени А.С. Пушкина

 

А.А. Сазанов

 

ОСНОВЫ ГЕНЕТИКИ

 

 

УЧЕБНОЕ ПОСОБИЕ

 

 

Санкт-Петербург

2011

УДК 159.99 575.1

 

Рецензенты:

Я.М. Галл, доктор биологических наук, профессор кафедры естествознания и географии Ленинградского государственного университета имени А.С. Пушкина

Е.Г. Неронова, кандидат биологических наук, начальник научно-исследовательской лаборатории биодозиметрии и клинической цитогенетики ФГУЗ Всероссийский центр экстренной и радиационной

медицины им. А.М. Никифорова МЧС России        

 

Сазанов А.А. Основы генетики для студентов-дефектологов: учебное пособие / А.А. Сазанов - СПб.: ЛГУ им. А.С. Пушкина, 2011. - ..с.

 

    В учебном пособии раскрываются основные положения классической и молекулярной генетики в применении к наследственным заболеваниям и генетическим особенностям человека. Существенное внимание уделено анализу родословных, прогнозированию генетического риска, использованию геномных баз данных, современным методам молекулярной и цитогенетической диагностики. Феноменологическое описание наследственных патологических состояний сочетается с раскрытием их генетической природы на хромосомном и молекулярном уровнях. В отдельном разделе рассмотрены наследственные нарушения умственного и физического развития.

    Учебное пособие предназначено в первую очередь для студентов-дефектологов. Книга может быть использована студентами-психологами, студентами-медиками и специалистами в области коррекционной педагогики и специальной психологии, а также генетики человека и медицинской генетики.

Печатается по решению редакционно-издательского совета
Ленинградского государственного университета имени А. С. Пушкина

 

ISBN

                                                         © Ленинградский государственный университет (ЛГУ) имени А. С. Пушкина, 2010  

ОГЛАВЛЕНИЕ

 

ПРЕДИСЛОВИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ГЛАВА I. Предмет, краткая история и основные положения генетики

ГЛАВА II. Классический генетический анализ

2.1 Моногенные различия

2.2 Типы взаимодействия аллелей

2.3 Генеалогический метод

2.4 Типы наследования

2.5 Полигенные различия

2.6 Взаимодействие генов

2.7 Сцепленное наследование

ГЛАВА III. Основы популяционной генетики

ГЛАВА IV. Близнецовый метод

ГЛАВА V. Цитогенетика человека

5.1 Внутриклеточные носители наследственной информации у человека - ядро и митохондрии

5.2 Митоз, мейоз и особенности созревания половых клеток человека

5.3 Структурно-функциональная организация хромосом

5.4 Дифференциальное окрашивание и блочная организация хромосом

5.5 Гибридизация in situ, хромосомный пейнтинг и сравнительная геномная гибридизация (CGH)

5.6 Теория старения в связи с динамикой структуры теломеры

5.7 Нормальный кариотип человека

5.8 Аномалии числа хромосом

5.9 Внутрихромосомные перестройки

ГЛАВА VI. Нуклеиновые кислоты

6.1 Структура ДНК и РНК  

6.2 Репликация ДНК

6.3 Транскрипция

6.4 Процессинг РНК.

6.5 Трансляция  

6.6 Рекомбинация

6.7 Репарация ДНК

6.8 Генная конверсия

6.9 Подвижные элементы генома.

6.10 Генные мутации

ГЛАВА VII. Основы молекулярной генетики

7.1 Геномика, транскриптомика, протеомика.         

7.2 Клонирование нуклеиновых кислот

7.3 Гибридизация нуклеиновых кислот

7.4 Геномные библиотеки.

7.5 Полимеразная цепная реакция (ПЦР).

7.6 Секвенирование ДНК.

7.7 Сборка сиквенсов геномов

7.8 Биоинформатика и системная биология

ГЛАВА VIII. Молекулярная организация генома человека

8.1 Повторяющиеся и уникальные последовательности ДНК

8.2 Композиционная гетерогенность

8.3 Ортология и паралогия

8.4 Геномные базы данных 

ГЛАВА IX. Наследственные болезни человека

9.1 Понятие, классификация и особенности наследственной патологии

9.2 Хромосомные болезни

9.3 Генные болезни

9.4 Молекулярные маркеры в изучении наследственной патологии  

ГЛАВА X. Цитогенетическая и молекулярно-генетическая диагностика наследственных заболеваний человека 10.1 Диагностика хромосомных болезней

10.2 Диагностика гетерозиготного носительства и определение генетического риска моногенных заболеваний

ГЛАВА XI. Наследственные нарушения умственного и физического развития

11.1 Роль генетических факторов в возникновении расстройств речи

11.2 Наследственные формы интеллектуальных нарушений

11.3 Генетика эмоционально-личностных расстройств и девиантного поведения

11.4 Наследственные формы нарушений опорно-двигательного аппарата.

11.5 Наследственные формы глухоты и тугоухости в детском возрасте

ГЛАВА XII. Современные подходы к лечению и профилактике наследственных заболеваний

12.1 Принципы генотерапии

12.2 Медико-генетическое консультирование

ПРЕДМЕТНЫЙ УКАЗАТЕЛЬ


ПРЕДИСЛОВИЕ

Предметом генетики являются наследственность и изменчивость – наиболее общие свойства живых организмов. Концептуальный характер генетики позволяет считать ее точной наукой наряду с математикой, физикой и химией. Таким образом, связывая биологию с другими естественнонаучными дисциплинами, генетика дает возможность формировать у студентов научное мышление на основе анализа и синтеза. Освоение логики генетического анализа содействует развитию дисциплины научного мышления. Прикладное значение генетики стремительно возрастает, что настоятельно требует качественного повышения уровня генетического образования.

    Для студентов-дефектологов особое значение имеет понимание общих принципов наследственной патологии, закономерностей развития и протекания наследственных заболеваний, знания методов диагностики и прогнозирования генетического риска, умение прочитать и понять цитогенетический диагноз. Особенности наследования заболеваний и предрасположенности к заболеваниям опорно-двигательного аппарата, эмоционально-личностных расстройств и девиантного поведения, глухоты и тугоухости, слепоты и слабовидения, расстройств речи также имеют существенное значение, как в общеобразовательной, так и в практической подготовке педагогов-дефектологов.

Знакомство с классическим генетическим анализом и классическими цитогенетическими методами позволит получить глубокое представление о природе наследственности и путях ее изучения. Знание современных положений геномики, транскриптомики, протеомики и системной биологии открывает перед учащимися возможность постоянно расширять и пополнять сведения о наследственных заболеваниях как с помощью специальной научной литературы, так и из ресурсов геномных баз данных, размещенных в сети Интернет.

Особое внимание в книге уделено составлению и анализу родословных, поскольку генеалогический метод лежит в основе генетического анализа у человека и служит как для понимания наследственной природы многих заболеваний, так и для прогнозирования генетического риска.

В последнее время все чаще практикуется совместное обучение детей с наследственными аномалиями и здоровых детей. Поэтому знание основ наследственной патологии человека будет полезным не только для дефектологов, но и для всех педагогов.

Студенты-биологи и студенты-медики, а также специалисты в данных областях смогут найти в книге систематизированные данные по наследственной патологии человека вообще и по влиянию наследственных факторов на различные формы нарушений развития у детей и подростков.

Автор искренне благодарен Анне Львовне Сазановой, оказавшей бесценную помощь при сборе материала, составлении иллюстраций и подготовке рукописи к печати.

Автор посвящает книгу светлой памяти своих родителей –Людмилы Николаевны и Александра Алексеевича.
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

 

АТ         – пара нуклеотидов аденин-тимин

ГЦ         – пара нуклеотидов гуанин-цитозин

кДНК    – комплементарная дезоксирибонуклеиновая кислота

мРНК     – матричная рибонуклеиновая кислота

пг          – пикограмм

п.н.        – пара нуклеотидов

ПЦР      – полимеразная цепная реакция

т.п.н.     – тысяча пар нуклеотидов

сМ         – сантиморган

ЯОР      – район ядрышкового организатора

BAC      – искусственная бактериальная хромосома

CGH       - сравнительная геномная гибридизация

EST       – экспрессирующаяся нуклеотидная последовательность

FISH     – флуоресцентная гибридизация ДНК-ДНК in situ

FLpter   – фракционное расстояния от теломера короткого плеча

                  хромосомы (выражается в долях единицы)

GTG        - G-окраска при помощи трипсина и красителя                                       

                  Романовского-Гимзы

HSA      – хромосома человека

ORF      – открытая рамка считывания

SNP       – сайт мононуклеотидного полиморфомизма


ГЛАВА I. Предмет, краткая история и основные положения генетики

    Генетика - это комплекс наук о свойствах живых организмов передавать свои признаки в ряду поколений (наследственность) и изменять свои признаки в силу различных причин (изменчивость).

    Указанные выше свойства живых организмов привлекали внимание людей в течение тысячелетий. Однако до открытия законов Менделя все они имели умозрительный характер. Очевидный факт наследуемого сходства особей одного вида, родителей и потомков, братьев и сестер находил иногда мифологические интерпретации. Во многих сказках фигурируют гибриды человека и животных и самые трудновообразимые гибриды различных видов животных. Нелепые теории вроде «телегонии» (влияния предыдущих половых партнеров на признаки потомков) или «волновой генетики» (существования наследственных физических полей, независимых от структуры ДНК) из глубины веков дошли до нашего времени в псевдонаучных изданиях.

    Теория прямого наследования, выдвинутая Гиппократом (460 до н. э. - 377 до н. э.) господствовала в научном и философском сознании долгое время. Согласно этой теории, каждый орган, ткань, клетка влияет на формирование половых задатков, которые передаются потомкам. Болезнь или здоровье родителей непосредственно передаются детям. Ж.-Б. Ламарк (1744-1829) - создатель одной из первых эволюционных теорий, в вопросах генетики следовал учению о прямом наследовании. Непосредственное влияние окружающей среды на органы, либо стимулирование организмов к упражнению органов вызывало, по его мнению, стойкие наследуемые изменения. По Ламарку «благоприобретенные» признаки служили основой для возникновения более совершенных существ. Основные положения ламаркизма - влияние среды на наследственность, превращения видов, отрицание роли естественного отбора - стали постулатами «мичуринской биологии» в СССР в 1930-1960 гг. Отдельные сторонники неоламаркизма встречаются до сих пор, несмотря на очевидность вреда от господства этого направления в биологии - уничтожения наиболее прогрессивных генетических школ в СССР и отставания от развитых стран в области биотехнологии, фармакологии, медицины и сельского хозяйства более чем на 50 лет.

    Интересно, что Ч. Дарвин (1809-1882) придерживался в общем-то ламаркистских взглядов на наследственность. Он верил, что в крови циркулируют «геммулы» (гипотетические частицы генетической информации), которые собирают сведения о состоянии органов и систем и несут ее в половые клетки, затем после оплодотворения из них развиваются клетки нового организма. Несмотря на то, что эта теория была опровергнута уже современниками Дарвина, до сих пор в языке присутствуют анахроничные понятия «кровность», «кровные родственники», «полукровки» и т.д., отражающие стойкость человеческих заблуждений о связи наследственности с кровью.

    Аристотель (384 до н. э. - 322 до н. э.) позволил себе усомниться в господствовавшей теории прямого наследования и предположить, что половые продукты образуются независимо от органов тела. Развитие эта идея получила в трудах немецкого зоолога А. Вейсмана (1834-1914), который экспериментально показал ненаследуемость механических повреждений. Он писал: «Как же могут сообщиться зародышевой клетке, лежащей внутри тела, изменения, произошедшие в мускуле благодаря его упражнению, или уменьшение, испытанное органом от неупотребления, и притом ещё сообщаться так, чтобы впоследствии, когда эта клетка вырастет в новый организм, она на соответствующем мускуле и на соответствующей части тела из самой себя произвела те же самые изменения, какие возникли у родителей в результате употребления или неупотребления? Вот вопрос, который встал передо мной уже давно и который, по дальнейшем его обдумывании, привел меня к полному отрицанию такой наследственной передачи приобретенных свойств». Этой идее суждено было принести плод в форме современных представлений о наследственности и изменчивости.

    Настоятель монастыря в Моравии Г.И. Мендель (1822 - 1884) будучи естествоиспытателем-любителем в свободное от работы время ставил опыты над горохом. Систематичность и упорядоченность этих опытов позволили ему найти наиболее фундаментальные принципы наследования признаков. Он руководствовался следующими соображениями:

- изучаемые признаки должны быть дискретны, т.е. без оттенков - либо есть, либо нет, либо белый, либо красный;

- признаки должны быть константны, т.е. неизменны в ряду поколений (Мендель проводил проверку в течение двух лет);

- в эксперименте должны использоваться родительские формы, различающиеся только по одному признаку;

- необходимо учитывать всех потомков от скрещивания дабы исключить влияние случайных событий.

    Крупная научная удача Менделя состояла в том, что выбранные им 7 признаков определялись генами на разных хромосомах, что исключало возможное сцепленное наследование. Он обнаружил, что

- у гибридов первого поколения присутствует признак только одной родительской формы, а другой «исчезает». Это закон единообразия гибридов первого поколения;

- во втором поколении наблюдается расщепление: три четверти потомков имеют признак гибридов первого поколения, а четверть - «исчезнувший» в первом поколении признак. Это закон расщепления.

- каждая пара признаков наследуется независимо от другой пары. Это закон независимого наследования.

    Разумеется, Мендель не знал, что эти положения со временем назовут первым, вторым и третьим законами Менделя. На этом научное везение великого генетика закончилось - последующие опыты на ястребинке не увенчались успехом из-за незнания биологии объекта. Современники-профессионалы дружно проигнорировали монаха-самоучку, и естественным наукам оставалось только накапливать экспериментальный материал, ожидая второго открытия законов Менделя через 37 лет после первой публикации.

    Начало XX-го столетия стало рубежом развития генетики - законы Менделя были переоткрыты в 1900 году Г. Де Фризом, К. Корренсом и Э. Чермаком на растениях, а в 1902 году У. Бэтсон и Е.Р. Саундерс подтвердили справедливость этих законов для животных в опытах на домашней курице. Немного позднее У. Бэтсон дополнил законы Менделя правилом чистоты гамет - каждая половая клетка (гамета) несет только один аллель из пары, присутствующей у диплоидной родительской особи. Им же было предложено название науки о наследственности и изменчивости - генетика.

    Понятия «ген» (элементарный наследственный фактор), «генотип» (совокупность генов организма), «фенотип» (совокупность признаков организма) введены В. Иогансеном (1857 - 1927). Он же предложил термин «чистая линия» для организмов с практически одинаковым генотипом, полученных путем близкородственного скрещивания (инбридинга).

    Явление сцепления - совместного ассоциированного наследования признаков, определяемых двумя или несколькими генами - было открыто У. Бэтсоном и Р. Пеннетом в 1906 году. Было также известно о связи наследования некоторых признаков с полом. Эти наблюдения стали основой для создания группой Т. Моргана, в которую входили А. Стертевант, К. Бриджес и Г. Меллер, хромосомной теории в 1910 году. Они проводили исследования на плодовой мушке дрозофиле (Drosophila melanogaster) - небольшом насекомом (2-3 мм) с удивительным разнообразием наследуемых признаков, малым числом хромосом (всего четыре пары) и возможностью отбора девственных самок. Другим подарком научной Фортуны стало наличие политенных хромосом в некоторых тканях двукрылых насекомых, к которым относится дрозофила, отличающихся от обычных митотических хромосом на несколько порядков по длине и имеющих поперечную исчерченность, которая позволяет проводить тонкое картирование (определение местоположения) генов. Все это дало возможность сформулировать хромосомную теорию:

- гены находятся в хромосомах и расположены линейно;

- полученные от каждого из родителей гомологичные хромосомы содержат парные аллели каждого гена;

- сцепление зависит от расстояния между генами и измеряется в сантиморганах - процентах рекомбинантных (имеющих сочетание аллелей, отличное от обеих родительских форм) особей;

- Гены, расположенные в одной хромосоме образуют группу сцепления и наследуются совместно при условии, что расстояние между ними менее 50 сантиморганов.

    Молекулярная эра развития генетики началась в 1944 году, когда группой американских исследователей было показано, что для превращения непатогенного штамма пневмококков в патогенный (отличающиеся наличием полисахаридной капсулы, которая позволяет закрепляться на тканях высших организмов), иными словами генетической трансформации, достаточно обработки клеток первого штамма ДНК, выделенной из второго штамма. Супруги Ледерберг и Н. Циндер в начале 1950-х выделили ДНК вируса кишечной палочки (бактериофаг лямбда) и описали явление трансдукции - переноса генов из одной бактерии в другую при помощи вирусов. Открытие явлений трансформации и трансдукции стало основанием для признания ДНК носителем генетической информации. В 1945 г. Дж. Бидлом и Э. Татумом было сформулировано положение «один ген - один фермент», которое после открытия доменной организации белков было исправлено на «один ген - один полипептид».

    Структура ДНК была расшифрована Дж. Уотсоном и Ф. Криком, что наряду с данными, полученными М. Ниренбергом (он синтезировал полиурациловую РНК и показал, что с нее считывается только фенилаланин) и С. Очоа (впервые провел синтез РНК с различным составом азотистых оснований и расшифровал коды для 11-ти аминокислот), дало возможность сформулировать следующие свойства генетического кода:

- каждая аминокислота в составе белка кодируется тремя азотистыми основаниями (триплетом);

- триплеты не перекрываются;

- считывание начинается со стартового триплета, знаки препинания в ДНК отсутствуют;

- одной аминокислоте может соответствовать более одного триплета (генетический код является вырожденным).

    Центральная догма молекулярной биологии, гласящая о том, что наследственная информация передается от нуклеиновых кислот к белку, но не в обратном направлении, была сформулирована группой исследователей под руководством Ф. Крика в 1961 году.

    Первый искусственный ген был синтезирован группой Х.Г. Кхорана в 1969 году. Примерно в это же время развивается генная инженерия - совокупность методов изменения нуклеиновых кислот в живых организмах. Техника рекомбинантной ДНК (объединенной из двух или более источников) позволила провести клонирование (получение большого числа идентичных копий) многих генов различных организмов, убедиться в универсальности генетического кода, изучить молекулярно-генетические механизмы физиологических процессов и патологических состояний.

    Следующий этап развития генетики - «постгеномная эра» - начался в 2003 году после выхода первого релиза полной последовательности ДНК (сиквенса) генома человека. Хотя некоторые участки генома, в первую очередь прицентромерные районы хромосом, которые содержат препятствующие клонированию повторы, остаются до сих пор непрочитанными (данные на 2010 год), комплекс данных полного сиквенса позволил создать геномные базы данных, что перевело исследования по генетике на качественно новый уровень. Вместо разрозненных сведений в отдельных экспериментальных статьях появился комплекс систематизированных данных по структуре нуклеиновых кислот, соответствующим им белковым продуктам, связанным с ними физиологическими особенностям и заболеваниям, месте и времени экспрессии, взаимном расположении, выявленных мутациях и о многих других важных биологических особенностях. Секвенирование геномов других организмов позволило применять сравнительный подход для поиска и характеристики наследственных патологических состояний и физиологических особенностей.

 

Контрольные вопросы и задания к главе I

1. Сформулируйте основное различие между концепциями прямого и непрямого наследования.

2. Изложите законы Менделя и раскройте их содержание.

3. В чем состоят основные положения хромосомной теории?

4. Сохраняет ли центральная догма молекулярной биологии значение в настоящее время?

 

Дополнительная литература к главеI

Фогель Ф., Мотульски А. Генетика человека. Т. 1 // М: Мир. 1989. 308 С.


 


Дата добавления: 2018-02-28; просмотров: 115; ЗАКАЗАТЬ РАБОТУ