Материалы и методы исследования
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ «НОВОСИБИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ АГРАРНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ»
БИОЛОГО-ТЕХНОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ
КАФЕДРА ВЕТЕРИНАРНОЙ ГЕНЕТИКИ И БИОТЕХНОЛОГИИ
ОТЧЕТ
о прохождении производственной практики
(научно-исследовательской работы)
Направление подготовки 36.03.02 Зоотехния (уровень бакалавриата)
профиль Технология производства продуктов животноводства
Место прохождения практики кафедра ветеринарной генетики и биотехнологии Новосибирского ГАУ
Сроки прохождения практики с 1 сентября 2020 г. по 14 сентября 2020 г.
Выполнил: студент 2301 группы
Седович Милена Евгеньевна
Проверил: д.б.н., профессора
Кочнев Николай Николаевич
Новосибирск 2020
Оглавление
ВВЕДЕНИЕ. 2
1. Обзор литературы.. 3
2. Материалы и методы исследования. 6
3. Результаты исследований. 10
Выводы.. 19
Библиографический список. 20
ВВЕДЕНИЕ
Мини-свиньи ИЦиГ СО РАН являются одной из групп, выведенных внутри домашней формы вида Sus scrofa (sus scrofa domestic). Мини-свиньи специально выведены для использования их в качестве лабораторных животных. Поведение мини-свиней ИЦиГ СО РАН соответствует психотипу домашней свиньи. Они безразлично-доброжелательны по отношению к людям.
|
|
|
Мини-свиней используют как биомоделей, в связи с тем, что они по своим анатомическим и физиологическим параметрам имеют меньше различий с человеком, на ряду с другими видами животных.
Цель исследования заключается в изучении влияния инбридинга на воспроизводительные качества лабораторных мини-свиней и создание базы данных в MC Excel.
Задача исследования состоит в расчете степени инбридинга, оценке основных статистических показателей по живой массе попросят при рождении, сохранность их, многоплодие свиноматок.
Обзор литературы
В России в разное время существовали три селекционные группы лабораторных мини-свиней. Первой из них стали минисибс, созданные на основе скрещиваний вьетнамской масковой породы, шведского ландраса и дикого кабана среднеазиатского подвида в разных сочетаниях родительских пар в конце 1960-х – начале 1970-х годов. Создание мини-сибс происходило на базе бывшего Экспериментального Хозяйства СО РАН в посёлке Каинская Заимка Новосибирского Района Новосибирской области под руководством В.Н. Тихонова. Позднее имели место прилития крови европейского дикого кабана (Тихонов, 2010). В 1988 г. минисибс были ликвидированы по причине вспышки бруцеллёза (Никитин и др., 2014). В 1974 г. в посёлке Светлые Горы (Московская обл.) на основании гибридов, полученных от скрещивания минисибс с геттингенскими мини-свиньями, были выведены светлогорские мини-свиньи, существующие до настоящего времени (Станкова и др., 2017).
|
|
|
Лабораторные мини-свиньи выведены специально для использования их в качестве лабораторных животных. Одна из гипотез гласит, что мини-свиньи являются искусственно воссозданными примитивными короткоухими свиньями, которые несут соответствующий комплекс рецессивных аллелей. Внешний вид животных, выведенных в Европе и США, совмещает в себе признаки примитивных короткоухих свиней европейского и восточноазиатского корня, и современных заводских пород. Поведение лабораторных мини-свиней соответствует психотипу домашней свиньи. Отношение к людям у них безразлично-доброжелательное. Весят они от 12 кг до 100-130 кг.
Лабораторные мини-свиньи по своим анатомическим и физиологическим параметрам имеют меньше различий с человеком, чем другие виды животных. Это способствовало выведению специальных селекционных групп мини-свиней. Помимо сходства систем организма мини-свиней с человеком, появление таких лабораторных животных обусловлено потребностью в дешевой биомодели.
|
|
|
Выводят мини-свиней тремя методами. Первый заключается в селекции мелких одичавших или примитивных домашних свиней на еще более мелкие размеры. Исходные формы весят 70-140 кг, при отборе на мелкие размеры – 50-60 кг (юкатанские мини-свиньи, омини, ли сонг). Исходные формы прошли миниатюризацию за счет существования небольшого числа родоначальников при ограниченности кормовых ресурсов, инбридинга и отсутствия притока генов.
Второй метод заключается в применении целенаправленного скрещивания. Метод направлен на создание группы мини-свиней путем восстановления мелкой примитивной короткоухой свиньи (например, хормельские мини-свиньи).
И, третий метод заключается в скрещивании крупной европейской и мелкой азиатской пород с дальнейшем разведением самых мелких помесей «в себе» (геттингентская порода мини-свиней).
Многие из селекционных групп лабораторных мини-свиней представляют собой самостоятельные закрытые стада, существующие в единственном числе. Исключением являются разве что NIH, хэнфордские, юкатанские и геттингенские мини-свиньи, представленные несколькими изолированными стадами, разводимыми на территории разных государств.
|
|
|
В разведении сельскохозяйственных животных из-за вероятности проявления инбредной депрессии близкородственные скрещивания не рекомендуется использовать в племенной работе, так как существует риск снижения продуктивности и измельчания животных.
При этом упоминается, что инбридинг является необходимым инструментом для консолидации желательных признаков, особенно при закладке новых типов и линий (Волкопялов, 1968; Кудрявцев, 1948; Редькин, 1946; Степанов, Михайлов, 1991).
В племенной работе с мини-свиньями инбридинг практически неизбежен из-за малочисленности стад (Chang et al., 2009; Nikitin et al., 2014). Однако способы его использования и их последствия могут варьировать между стадами. В разведении мини-свиней ИЦиГ СО РАН инбридинг используется и в рутинной работе по нескольким направлениям (Никитин и др., 2018).
Первое из них – плановый инбридинг на родоначальников или особо ценных животных из-за чего родословная каждой племенной особи «закольцована» на общего предка в третьем или четвёртом поколении (Зоотехнические, 2019).
Второе направление – проверка хряков на носительство вредных рецессивных мутаций посредством скрещиваний с матерями сёстрами и полусёстрами по методу А.С. Серебровского (1970).
Материалы и методы исследования
Научно-исследовательская практика была пройдена в период с 1 сентября 2020 года по 14 сентября 2020 года на кафедре ветеринарной генетики и биотехнологии Новосибирского ГАУ.
За время прохождения практики было изучено влияние инбридинга и уровня гомозиготности на показатели воспроизводства у лабораторных мини- свиней, а также их потомства. Исходные данные были любезно предоставлены сотрудниками ИЦиГ СО РАН: старшим научным сотрудником лаборатории молекулярной генетики и селекции сельскохозяйственных животных, кандидатом биологических наук Никитиным Сергеем Вячеславовичем и зоотехником питомника мини-свиней Запорожец Верой Ивановной. Данные были отправлены в виде прикрепленных файлов по электронной почте.
Материалом для исследований послужили данные зоотехнического учёта племенных особей селекционной группы ИЦиГ СО РАН. Стадо происходит от скрещивания в 1990-1992 годах свинок крупной белой породы и хряков светлогорских мини-свиней с последующими прилитиями крови хряков породы ландрас и вьетнамской пастбищной свиньи (Никитин и др., 2014). Таким образом, генофонд мини-свиней ИЦиГ СО РАН содержит фрагменты генофондов крупной (ландрас и крупная белая породы) и мелкой (светлогорские и вьетнамские свиньи) формы домашней свиньи.
По данным зоотехнического учёта установлен информация о происхождении племенных животных, живая масса поросят при рождении и их количество в подсосный период. На их основании по каждой особи индивидуально были рассчитаны доли крови родоначальников и родоначальниц по формуле:
Где Р – доля крови родоначальника у данной особи, 
. – доля крови родоначальника у отца, 
– доля крови родоначальника у матери. Коэффициент инбридинга вычисляли по модифицированной формуле Райта-Кисловского:
(Никитин и др, 2014).
Где F – коэффициент инбридинга особи, Fo – коэффициент инбридинга отца, Fm – коэффициент инбридинга матери, Ро – доля крови родоначальника у отца, Pm – доля крови родоначальника у матери.
Сохранность поросят в подсосный период была разделена на два показателя: биологическая (от рождения до отъёма) и зоотехническая (с 6-дневного возраста до отъёма). Общая формула расчёта сохранности выглядит как:
Где n 0 и ni –количество живых поросят в начале и в конце изучаемого периода.
Показатели описательной статистики рассчитывали при помощи общепринятых алгоритмов (Лакин, 1990; Теория статистики, 2010). В соответствии с рекомендациями (Айвазян, Мхитарян, 2001; Лакин, 1990), динамику доли крови и коэффициента инбридинга оценивали методом регрессионного анализа. Непосредственное вычисление коэффициента регрессии проводили при помощи приложения General Regression Models/ Simple regression, входящего в пакет программ STATISTICA8. Связь между признаками оценивали посредством коэффициента корреляции, который рассчитывали при помощи соответствующего приложения в пакете программного обеспечения STATISTICA8.
В распоряжении были базы данных MC Excel, где и проводилась статистическая обработка данных: подсчет среднего значения, среднего отклонения, расчет средних долей крови и коэффициентов инбридинга по каждому поколению, индекс генетического сходства.
Сама база данных содержит информацию по хрякам и свиноматкам, их индивидуальных номерах, долях крови свиноматок (голубой цвет) и хряков (желтый цвет), коэффициентах инбридинга.
Возрастной состав экспериментальных групп был различным. Животные были разделены по годам и поколениям, начиная с 1990 года по 2020 (15-16 поколений).
Результаты исследований
Коэффициенты инбридинга родоначальников КБ1912, МС2913 и ВТН3001 имели значения, практически не отличимые от нуля и были исключены из анализа.
Рисунок 1. Динамика суммарных коэффициентов инбридинга
Таблица 1. Динамика коэффициента инбридинга на родоначальников мини-свиней ИЦиГ СО РАН по поколениям
| Поколение | КБ1902 | КБ1906 | КБ1910 | КБ1926 | MC2853 | MC2987 | ЛНДР03 | ЛНДР07 | ВНТ300 | ВНТ3001 |
| 1 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,01563 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 3 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00156 | 0,00000 | 0,01875 | 0,04941 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 4 | 0,00000 | 0,00087 | 0,00043 | 0,00087 | 0,01147 | 0,04454 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 5 | 0,00029 | 0,00088 | 0,00078 | 0,00088 | 0,01408 | 0,04044 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 6 | 0,00000 | 0,00049 | 0,00153 | 0,00145 | 0,01928 | 0,04329 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 7 | 0,00005 | 0,00056 | 0,00132 | 0,00112 | 0,01486 | 0,03438 | 0,00174 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 8 | 0,00002 | 0,00024 | 0,00107 | 0,00111 | 0,01164 | 0,02422 | 0,00058 | 0,00042 | 0,00000 | 0,00000 |
| 9 | 0,00001 | 0,00057 | 0,00117 | 0,00114 | 0,01258 | 0,02710 | 0,00000 | 0,00046 | 0,00859 | 0,00000 |
| 10 | 0,00001 | 0,00030 | 0,00135 | 0,00128 | 0,01253 | 0,02752 | 0,00021 | 0,00055 | 0,00662 | 0,00000 |
| 11 | 0,00001 | 0,00033 | 0,00150 | 0,00128 | 0,01250 | 0,02766 | 0,00013 | 0,00061 | 0,00834 | 0,00000 |
| 12 | 0,00001 | 0,00042 | 0,00117 | 0,00124 | 0,01250 | 0,02776 | 0,00026 | 0,00063 | 0,00843 | 0,00000 |
| 13 | 0,00001 | 0,00034 | 0,00120 | 0,00128 | 0,01276 | 0,02864 | 0,00025 | 0,00056 | 0,00722 | 0,00000 |
| 14 | 0,00001 | 0,00031 | 0,00097 | 0,00102 | 0,01031 | 0,02388 | 0,00015 | 0,00040 | 0,00514 | 0,00000 |
| 15 | 0,00001 | 0,00033 | 0,00114 | 0,00121 | 0,01196 | 0,02794 | 0,00016 | 0,00050 | 0,00619 | 0,00014 |
| 16 | 0,00001 | 0,00035 | 0,00126 | 0,00136 | 0,01303 | 0,02982 | 0,00010 | 0,00050 | 0,00625 | 0,00023 |
| Коэффициент регрессии | -0,16941 | 0,10116 | 0,52609 | 0,75137 | 0,05680 | -0,41369 | 0,02059 | 0,83163 | 0,77914 | 0,58191 |
| Ошибка | 0,53 | 0,26589 | 0,227287 | 0,176362 | 0,276902 | 0,252504 | 0,277291 | 0,15402 | 0,17386 | 0,22556 |
| Достоверность | 0,263 | 0,709 | 0,036* | 0,0008*** | 0,841 | 0,125 | 0,942 | 0,0001*** | 0,0006*** | 0,023* |
Таблица 2. Динамика коэффициента инбридинга по годам
| Год рождения | КБ1902 | КБ1906 | КБ1910 | КБ1926 | MC2853 | MC2987 | ЛНДР3 | ЛНДР7 | ВНТ300 |
| 1990 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1991 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1992 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,01563 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1993 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1994 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,02344 | 0,03662 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1995 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00313 | 0,00000 | 0,01875 | 0,06953 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1996 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00781 | 0,00781 | 0,08636 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1997 | 0,00000 | 0,00156 | 0,00078 | 0,00000 | 0,01909 | 0,06290 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1998 | 0,00000 | 0,00049 | 0,00000 | 0,00024 | 0,00074 | 0,01199 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 1999 | 0,00024 | 0,00098 | 0,00122 | 0,00098 | 0,01698 | 0,04764 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2000 | 0,00065 | 0,00065 | 0,00065 | 0,00033 | 0,01432 | 0,02556 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2002 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00294 | 0,00294 | 0,02770 | 0,04811 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2003 | 0,00000 | 0,00098 | 0,00684 | 0,00784 | 0,01933 | 0,03949 | 0,00000 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2004 | 0,00008 | 0,00041 | 0,00147 | 0,00151 | 0,01703 | 0,04510 | 0,00260 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2005 | 0,00004 | 0,00110 | 0,00126 | 0,00120 | 0,01525 | 0,04851 | 0,00130 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2006 | 0,00007 | 0,00016 | 0,00146 | 0,00118 | 0,01648 | 0,02540 | 0,00173 | 0,00000 | 0,00000 |
| 2007 | 0,00000 | 0,00038 | 0,00121 | 0,00118 | 0,01295 | 0,02996 | 0,00000 | 0,00020 | 0,00000 |
| 2008 | 0,00000 | 0,00073 | 0,00100 | 0,00103 | 0,01087 | 0,02489 | 0,00000 | 0,00038 | 0,00000 |
| 2009 | 0,00000 | 0,00035 | 0,00126 | 0,00121 | 0,01368 | 0,02974 | 0,00000 | 0,00044 | 0,00732 |
| 2010 | 0,00000 | 0,00022 | 0,00094 | 0,00106 | 0,00989 | 0,02067 | 0,00015 | 0,00064 | 0,01025 |
| 2011 | 0,00001 | 0,00031 | 0,00162 | 0,00128 | 0,01270 | 0,02801 | 0,00018 | 0,00059 | 0,00638 |
| 2012 | 0,00001 | 0,00031 | 0,00119 | 0,00131 | 0,01234 | 0,02758 | 0,00018 | 0,00066 | 0,01050 |
| 2013 | 0,00000 | 0,00029 | 0,00129 | 0,00143 | 0,01332 | 0,02856 | 0,00006 | 0,00066 | 0,00776 |
| 2014 | 0,00001 | 0,00038 | 0,00119 | 0,00123 | 0,01296 | 0,02963 | 0,00039 | 0,00058 | 0,00667 |
| 2015 | 0,00001 | 0,00037 | 0,00124 | 0,00134 | 0,01304 | 0,02984 | 0,00019 | 0,00056 | 0,00731 |
| 2016 | 0,00001 | 0,00062 | 0,00122 | 0,00126 | 0,01323 | 0,03137 | 0,00038 | 0,00051 | 0,00498 |
| 2017 | 0,00001 | 0,00036 | 0,00116 | 0,00122 | 0,01240 | 0,02856 | 0,00020 | 0,00051 | 0,00700 |
| 2018 | 0,00001 | 0,00044 | 0,00128 | 0,00134 | 0,01363 | 0,03278 | 0,00023 | 0,00047 | 0,00520 |
| 2019 | 0,00001 | 0,00029 | 0,00099 | 0,00105 | 0,01041 | 0,02396 | 0,00013 | 0,00042 | 0,00548 |
| Коэффициент регрессии | -0,11173 | 0,17351 | 0,20252 | 0,08346 | 0,26634 | -0,00190 | 0,14972 | 0,83789 | 0,75590 |
| Ошибка | 0,19125 | 0,18953 | 0,18846 | 0,19178 | 0,18550 | 0,19245 | 0,19028 | 0,10505 | 0,12600 |
| Достоверность | 0,56392 | 0,36806 | 0,29208 | 0,66688 | 0,16254 | 0,99220 | 0,43824 | 0,00000 | 0,00000 |
Рисунок 2. Динамика коэффициентов инбридинга родоначальников крупной формы по поколениям. Ось абсцисс – поколения, ординат – коэффициент инбридинга
Рисунок 3. Динамика коэффициентов инбридинга родоначальников мелкой формы. Ось абсцисс – поколения, ординат – коэффициент инбридинга
Таблица 3. Динамика долей крови родоначальников по поколениям
| Поколение | КБ1902 | КБ1906 | FКБ1910 | КБ1912 | КБ1926 | MC2853 | MC2913 | MC2987 | ЛНДР3 | ЛНДР7 | ВНТ300 | ВНТ3001 |
| 1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 2 | 0,0625 | 0,03125 | 0,09375 | 0,03125 | 0,03125 | 0,40625 | 0,03125 | 0,3125 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 3 | 0,025 | 0,0625 | 0,075 | 0,0125 | 0,075 | 0,3 | 0,0125 | 0,4375 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 4 | 0,020833 | 0,055556 | 0,0625 | 0 | 0,069444 | 0,236111 | 0 | 0,388889 | 0,111111 | 0,055556 | 0 | 0 |
| 5 | 0,021875 | 0,065625 | 0,059375 | 0,00625 | 0,059375 | 0,234375 | 0,00625 | 0,396875 | 0,1 | 0,05 | 0 | 0 |
| 6 | 0,011719 | 0,05013 | 0,082682 | 0,005208 | 0,078125 | 0,277344 | 0,005208 | 0,401042 | 0,052083 | 0,036458 | 0 | 0 |
| 7 | 0,009549 | 0,045139 | 0,072917 | 0,003472 | 0,068576 | 0,240451 | 0,003472 | 0,355035 | 0,055556 | 0,034722 | 0,111111 | 0 |
| 8 | 0,008557 | 0,031064 | 0,069382 | 0,000372 | 0,068824 | 0,225446 | 0,000372 | 0,30878 | 0,043155 | 0,041667 | 0,178571 | 0,02381 |
| 9 | 0,008203 | 0,035547 | 0,068457 | 0 | 0,069043 | 0,222363 | 0 | 0,321387 | 0,041406 | 0,046094 | 0,1875 | 0 |
| 10 | 0,005469 | 0,035664 | 0,068984 | 0,000625 | 0,071211 | 0,221367 | 0,000625 | 0,323867 | 0,027188 | 0,0475 | 0,1775 | 0,02 |
| 11 | 0,00514 | 0,035439 | 0,06895 | 0,000925 | 0,071443 | 0,221474 | 0,000925 | 0,323294 | 0,026316 | 0,048725 | 0,177632 | 0,019737 |
| 12 | 0,006261 | 0,036104 | 0,06823 | 0,000804 | 0,070758 | 0,221349 | 0,000804 | 0,324319 | 0,031824 | 0,050207 | 0,181985 | 0,007353 |
| 13 | 0,005624 | 0,036994 | 0,069361 | 0,000859 | 0,071468 | 0,223155 | 0,000859 | 0,328902 | 0,029011 | 0,047346 | 0,168103 | 0,018319 |
| 14 | 0,004965 | 0,034955 | 0,063087 | 0,000837 | 0,064888 | 0,20268 | 0,000837 | 0,302694 | 0,025346 | 0,040515 | 0,142299 | 0,019481 |
| 15 | 0,005037 | 0,037035 | 0,067206 | 0,001029 | 0,069359 | 0,215903 | 0,001029 | 0,322065 | 0,02596 | 0,044155 | 0,15625 | 0,019345 |
| 16 | 0,003959 | 0,037654 | 0,070995 | 0,000887 | 0,073661 | 0,225344 | 0,000887 | 0,335238 | 0,019613 | 0,044588 | 0,158008 | 0,029167 |
Таблица 4. Динамика долей крови родоначальников по годам
| Год рождения | КБ 1902 | КБ 1906 | КБ 1910 | КБ 1912 | КБ 1926 | MC 2853 | MC 2913 | MC 2987 | ЛНДР3 | ЛНДР7 | ВНТ 300 | ВНТ 3001 |
| 1990 | 0,125 | 0,000 | 0,125 | 0,125 | 0,125 | 0,125 | 0,125 | 0,250 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1991 | 0,000 | 0,500 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,500 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1992 | 0,063 | 0,031 | 0,094 | 0,031 | 0,031 | 0,186 | 0,088 | 0,222 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1993 | 0,000 | 0,125 | 0,000 | 0,125 | 0,000 | 0,250 | 0,125 | 0,375 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1994 | 0,031 | 0,031 | 0,094 | 0,000 | 0,094 | 0,344 | 0,000 | 0,406 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1995 | 0,025 | 0,075 | 0,075 | 0,000 | 0,075 | 0,275 | 0,000 | 0,475 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1996 | 0,000 | 0,063 | 0,000 | 0,000 | 0,188 | 0,188 | 0,000 | 0,563 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1997 | 0,013 | 0,075 | 0,088 | 0,000 | 0,075 | 0,275 | 0,000 | 0,475 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 1998 | 0,031 | 0,039 | 0,039 | 0,000 | 0,031 | 0,172 | 0,000 | 0,250 | 0,250 | 0,188 | 0,000 | 0,000 |
| 1999 | 0,016 | 0,070 | 0,070 | 0,016 | 0,063 | 0,266 | 0,016 | 0,422 | 0,063 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 2000 | 0,042 | 0,052 | 0,052 | 0,000 | 0,042 | 0,229 | 0,000 | 0,333 | 0,167 | 0,083 | 0,000 | 0,000 |
| 2002 | 0,000 | 0,031 | 0,109 | 0,000 | 0,109 | 0,328 | 0,000 | 0,422 | 0,000 | 0,000 | 0,000 | 0,000 |
| 2003 | 0,016 | 0,044 | 0,078 | 0,005 | 0,081 | 0,279 | 0,005 | 0,388 | 0,083 | 0,021 | 0,000 | 0,000 |
| 2004 | 0,010 | 0,049 | 0,083 | 0,000 | 0,081 | 0,268 | 0,000 | 0,404 | 0,063 | 0,042 | 0,000 | 0,000 |
| 2005 | 0,013 | 0,068 | 0,072 | 0,005 | 0,066 | 0,246 | 0,005 | 0,421 | 0,073 | 0,031 | 0,000 | 0,000 |
| 2006 | 0,013 | 0,030 | 0,077 | 0,000 | 0,069 | 0,250 | 0,000 | 0,319 | 0,063 | 0,036 | 0,143 | 0,000 |
| 2007 | 0,009 | 0,038 | 0,071 | 0,000 | 0,070 | 0,230 | 0,000 | 0,332 | 0,056 | 0,044 | 0,150 | 0,000 |
| 2008 | 0,008 | 0,033 | 0,067 | 0,001 | 0,068 | 0,220 | 0,001 | 0,311 | 0,039 | 0,046 | 0,205 | 0,000 |
| 2009 | 0,008 | 0,039 | 0,071 | 0,001 | 0,070 | 0,231 | 0,001 | 0,336 | 0,040 | 0,043 | 0,160 | 0,000 |
| 2010 | 0,005 | 0,030 | 0,064 | 0,001 | 0,066 | 0,205 | 0,001 | 0,290 | 0,025 | 0,049 | 0,226 | 0,038 |
| 2011 | 0,006 | 0,036 | 0,069 | 0,001 | 0,071 | 0,222 | 0,001 | 0,325 | 0,028 | 0,049 | 0,170 | 0,022 |
| 2012 | 0,005 | 0,034 | 0,069 | 0,000 | 0,073 | 0,222 | 0,000 | 0,323 | 0,025 | 0,051 | 0,197 | 0,000 |
| 2013 | 0,004 | 0,034 | 0,072 | 0,001 | 0,075 | 0,228 | 0,001 | 0,329 | 0,020 | 0,051 | 0,176 | 0,010 |
| 2014 | 0,008 | 0,039 | 0,069 | 0,001 | 0,070 | 0,225 | 0,001 | 0,335 | 0,040 | 0,048 | 0,164 | 0,000 |
| 2015 | 0,005 | 0,038 | 0,071 | 0,001 | 0,073 | 0,226 | 0,001 | 0,335 | 0,025 | 0,047 | 0,167 | 0,013 |
| 2016 | 0,007 | 0,041 | 0,070 | 0,001 | 0,071 | 0,227 | 0,001 | 0,344 | 0,038 | 0,046 | 0,143 | 0,012 |
| 2017 | 0,006 | 0,038 | 0,068 | 0,001 | 0,070 | 0,220 | 0,001 | 0,326 | 0,030 | 0,045 | 0,167 | 0,029 |
| 2018 | 0,006 | 0,042 | 0,071 | 0,001 | 0,073 | 0,230 | 0,001 | 0,350 | 0,033 | 0,043 | 0,143 | 0,006 |
| 2019 | 0,005 | 0,034 | 0,063 | 0,001 | 0,065 | 0,203 | 0,001 | 0,302 | 0,023 | 0,041 | 0,148 | 0,028 |
| Коэффициент регрессии | -0,500** | -0,356 | 0,123 | -0,457* | 0,054 | 0,151 | -0,501** | -0,322 | 0,035 | 0,359 | 0,831*** | 0,579** |
| Ошибка | 0,167 | 0,180 | 0,191 | 0,171 | 0,054 | 0,190 | 0,167 | 0,182 | 0,192 | 0,180 | 0,107 | 0,157 |
Рисунок 4. Динамика долей крови родоначальников крупной формы по поколениям. Ось абсцисс – поколения, ординат – доля крови
Рисунок 5. Динамика долей крови родоначальников мелкой формы по поколениям. Ось абсцисс – поколения, ординат – доля крови
Таблица 5. Динамика показателей воспроизводства мини-свиней ИЦиГ СО РАН за 2012-2018 годы
| Показатель | Год | ||||||
| 2012 | 2013 | 2014 | 2015 | 2016 | 2017 | 2018 | |
| Живая масса поросёнка при рождении, г | |||||||
| n | 167 | 483 | 326 | 364 | 399 | 173 | 180 |
| 639,64± 8,64 | 701,29± 5,92 | 709,28± 6,99 | 669,05± 6,88 | 682,31± 7,21 | 706,75± 12,25 | 651,39± 10,97 |
| lim | 450‒960 | 310‒1200 | 400‒1100 | 380‒1500 | 370‒1100 | 400‒1200 | 300‒980 |
| S | 111,294 | 129,886 | 125,954 | 131,075 | 143,75 | 160,616 | 146,805 |
| Многоплодие свиноматок, гол | |||||||
| Число гнёзд | 67 | 80 | 44 | 49 | 61 | 42 | 32 |
|
| 5,57±0,28 | 6,89±0,23 | 7,52±0,41 | 7,41±0,39 | 6,77±0,27 | 6,31±0,29 | 6,63±0,30 |
| lim | 1‒12 | 2‒12 | 2‒12 | 3‒14 | 2‒13 | 2‒11 | 4‒10 |
| S | 2,26 | 2,04 | 2,72 | 2,70 | 2,07 | 1,89 | 1,68 |
| Сохранность | |||||||
| Биологическая, % | 50,13±6,11 | 73,14±4,96 | 68,88±6,98 | 64,46±6,84 | 65,38±6,09 | 71,70±6,95 | 63,68±8,13 |
| Зоотех-ническая, % | ‒ | 81,25±4,36 | 85,07±5,37 | 88,64±4,53 | 85,71±4,48 | 94,06±3,65 | 92,47±4,46 |
Таблица 6. Корреляция между показателями воспроизводства и коффициентом инбридинга
| Родоначальник | Живая масса поросёнка при рождении | Многоплодие | Сохранность биологическая | Сохранность зоотехническая |
| КБ1902 | 0,124 | 0,400 | -0,045 | -0,158 |
| КБ1906 | -0,052 | 0,167 | 0,026 | -0,201 |
| КБ1910 | -0,240 | 0,291 | 0,143 | -0,465 |
| КБ1926 | -0,298 | 0,001 | -0,019 | -0,252 |
| МС2853 | -0,020 | 0,536 | 0,347 | -0,628 |
| МС2987 | -0,190 | 0,358 | 0,131 | -0,243 |
| ЛНДР03 | 0,160 | 0,327 | -0,024 | -0,127 |
| ЛНДР07 | -0,006 | -0,207 | -0,240 | -0,029 |
| ВТН300 | -0,299 | -0,531 | -0,545 | 0,511 |
| Суммарный коэф-т инбридинга | -0,769* | -0,020 | -0,510 | 0,106 |
| По крупной форме | -0,120 | 0,342 | -0,077 | -0,484 |
| По мелкой форме | -0,801* | -0,072 | -0,533 | 0,184 |
Таблица 7. Корреляция между долями крови родоначальников и воспроизводительными качествами
| Родоначальник | Живая масса поросёнка при рождении | Многоплодие | Сохранность биологическая | Сохранность зоотехническая |
| КБ1902 | 0,177 | 0,199 | 0,018 | -0,050 |
| КБ1906 | -0,033 | 0,358 | 0,140 | -0,147 |
| КБ1910 | -0,211 | 0,337 | 0,183 | -0,500 |
| КБ1912 | 0,321 | 0,179 | 0,457 | 0,119 |
| КБ1926 | -0,358 | -0,050 | -0,090 | -0,194 |
| МС2853 | -0,188 | 0,414 | 0,162 | -0,525 |
| МС2913 | 0,321 | 0,179 | 0,457 | 0,119 |
| МС2987 | -0,181 | 0,398 | 0,126 | -0,296 |
| ЛНДР03 | 0,221 | 0,295 | 0,085 | -0,113 |
| ЛНДР07 | 0,080 | -0,114 | -0,166 | -0,116 |
| ВТН300 | -0,154 | -0,455 | -0,419 | 0,410 |
| ВТН3001 | 0,436 | -0,049 | 0,544 | -0,024 |
| По крупной форме | 0,130 | 0,438 | 0,092 | -0,331 |
| По мелкой форме | -0,127 | -0,438 | -0,089 | 0,332 |
Выводы
На основании полученных результатов, следуют выводы о проделанной работе:
1. Рассчитано стандартное отклонение долей крови и коэффициента инбридинга для каждого родоначальника и родоначальницы по поколениям.
2. Рассортировать данные по годам в MCExcel. Точно так же рассчитаны средние доли крови и коэффициент инбридинга для каждого родоначальника и родоначальницы.
3. Построены графики средних значений долей крови, коэффициента инбридинга и суммарного коэффициента инбридинга (предварительно вычислив среднее) по годам и поколениям.
4. Найден коэффициент корреляции с долей крови и коэффициентом инбридинга по каждому родоначальнику и каждой родоначальнице в стаде, а также по суммарному инбридингу, значения взяты из таблицы данных многоплодия, крупноплодия и сохранности за 2012 – 2018 годы.
5. Построены графики сравнения данных многоплодия, крупноплодия и сохранности за 2012 – 2018 годы с долями крови родоначальников и родоначальниц, а также по суммарному инбридингу.
Библиографический список
1. Алтухов Ю.П. Генетика популяций и сохранение биоразнообразия. Соросовский Образовательный Журнал, 1995; 1: 32-43. http://www.rusphysics.ru/files/% 5BAltuhov_YU.P.%5D_Genetika_populyacy_i_sohranenie_bi%28BookFi.org%29.pdf
2. Горелов И.Г.,Савина М.А., Ермолаев В.И.Сибирские миниатюрные свиньи – новая биомодель для медико-биологических исследований. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2001; 3–4: С. 81-87. [Gorelov I.G., Savina M.A., Ermolaev V.I. Sibirian miniature pigs is a new model for biomedical experiments. Sibirskiy vestnik selskokhozyaistvennoi nauki=Siberian bulliten of agricultural science, 2001; (3-4): 81-87].
3. Дубинин Н.П., Глембоцкий Я.Л. Генетика популяций и селекция. М.: «Наука», 1967. – 592 с. [Dubinin N.P., Glembotskiy Ya.L. Population genetics and selection. Moscow.: ‘Nauka’ Publ. 1967; 592 p. (In Russian)].
4. Лэсли Дж. Ф. Генетические основы селекции сельскохозяйственных животных. –М.: Колос. 1982. – 392 с.
5. Никитин С.В. , Князев С.П. , Шатохин К.С., Запорожец В.И., Башур Д.С., Ермолаев В.И. Пренатальный рост живой массы и масть мини-свиней ИЦиГ СО РАН. Сельскохозяйственные технологии, 2019; 1(3): 21-34. [Nikitin S.V., Knyazev S.P., Shatokhin K.S., Zaporozhets V.I., Bashur D.S., Ermolaev V.I. Prenatal growth of live weight and coat color of the mini pigs of ICG SB RAS. Agricultural Technologies, 2019; 1(3): 21-34. (in Russian)] https://doi.org/10.35599/agritech/01.03.04
6. Никитин С.В., Князев С.П., Ермолаев В.И. Роль условий среды пренатального роста плодов в формировании массы новорожденной особи у домашних свиней. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2017; 21(5): 569-575. [Nikitin S.V., Knyazev S.P., Ermolayev V.I. The influence of prenatal environmental conditions on the weight of newborn domestic pigs. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2017;21(5):569-575. (in Russian)] DOI 10.18699/VJ17.273
7. Никитин С.В., Князев С.П., Шатохин К.С., Гончаренко Г.М., Запорожец В.И., Ермолаев В.И. Ювенильные окраски мини-свиней селекции ИЦиГ СО РАН. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017;21(6):638-645. [Nikitin S.V., Knyazev S.P., Shatokhin K.S., Goncharenko G.M., Zaporozhets V.I., Ermolayev V.I. Juvenile coat colours in mini-pigs at ICG. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii=Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2017;21(6):638-645 (in Russian)] DOI 10.18699/VJ17.280
8. Никитин С.В., Князев С.П., Шатохин К.С., Запорожец В.И., Ермолаев В.И. Разведение и селекция мини-свиней ИЦиГ СО РАН. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2018;22(8):922-930. [Nikitin S.V., Knyazev S.P., Shatokhin K.S., Zaporozhets V.I., Ermolaev V.I. Breeding and selection of mini-pigs in the ICG SB RAS. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2018;22(8):922-930. (in Russian)]. DOI 10.18699/VJ18.434
9. Никитин С.В., Князев С.П..Отбор и адаптация в популяциях домашних свиней. Lambert Academy Publishing, 2015. – 228 с.
10. Никитин С.В., Шатохин К.С., Князев С.П., Гончаренко Г.М., Запорожец В.И., Ермолаев В.И. Полиморфизм локусов масти у мини-свиней. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2016;20(5):584-595. [Nikitin S.V., Shatokhin K.S., Knyazev S.P., Goncharenko G.M., Zaporozhets V.I., Ermolayev V.I. Polymorphic loci of coat color in mini-pigs. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2016; 20(5): 584-595 (in Russian)]. DOI 10.18699/VJ16.180
11. Никитин С .В ., Юдин Н .С ., Князев С .П ., Айтназаров Р .Б ., Кобзев В .Ф ., Бекенёв В .А ., Савина М .А ., Ермолаев В .И . Оценка частоты хромосом, содержащих свиные эндогенные ретровирусы, в популяциях домашней свиньи и дикого кабана. Генетика, 2008; 44(6): 789-797.
12. Редькин А.П. Свиноводство. Огиз, Сельхозгиз, 1946. – 345 с.
13. Серебровский А.С. Генетический анализ. М.: «Наука», 1970. – 342 с.
14. Станкова Н.В., Капанадзе Г.Д. Оптимизация светлогорских мини-свиней для биомедицинских исследований. Биомедицина, 2010; 5: 33-49 [Stankova N.V., Kapanadze G.D. Optimization of svetlogorskaya minipig population for the biomedical researchers. Biomeditsina = Biomedicine, 2010; 5: 33-49 (in Russian)]
15. Станкова Н.В., Савина М.А., Капанадзе Г.Д. Формирование новых линий светлогорских мини-свиней. Биомедицина, 2017; 3: 95-101. [Stankova N.V., Savina M.A., Kapanadze G.D. The formation of new lines of Svetlogorsk minipigs. Biomeditsina = Biomedicine. 2017; 3: 95-101. (in Russian)]
16. Тихонов В.Н. Лабораторные мини-свиньи: генетика и медико-биологическое использование. Ин-т цитологии и генетики СО РАН. – Новосибирск, 2010. – 304 с.
17. Шатохин К.С., Князев С.П., Гончаренко Г.М., Никитин С.В. Влияние интродукции аллелей на состояние аллелофонда локусов систем групп крови в популяции миниатюрных свиней ИЦиГ СО РАН. Вестн. НГАУ. 2014а;33(4):119-124. [Shatokhin K.S., Knyazev S.P., Goncharenko G.M., Nikitin S.V. The effect of allele introduction on the status of the allele pool of blood group system loci in the population of minipigs in the Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk. Vestnik NGAU = Bulletin of the Novosibirsk State Agrarian University. 2014а; 33(4): 119-124. (in Russian)]
18. Шатохин К.С., Никитин С.В., Запорожец В.И., Князев С.П., Ходакова А.В., Башур Д.С., Величко К.Д. Крупноплодность мини-свиней ИЦиГ СО РАН: потенциал нереализуемых возможностей. Вестник НАУ, 2020; в печати [Shatokhin K.S., Nikitin S.V., Zaporozhets V.I., Kyazev S.P., Khodakova A.V., Bashur D.S., Velichko K.D. The weight of newborn piglets of mini-pigs ICG SB RAS: potential of unrealizable. Vestnik NGAU = Bulletin of the Novosibirsk State Agrarian University, 2020; in print (in Russian)]
19. Шатохин К.С., Никитин С.В., Запорожец В.И., Князев С.П., Башур Д.С., Блажко Н.В., Ходакова А.В.Основные принципы селекции лабораторных мини-свиней. Новейшие направления развития аграрной науки в работах молодых ученых: сборник материалов VII международной научно-практической конференции (15-17 октября 2019 года, г. Новосибирск). – С. 184-187.
20. Chu H.-P. Selection and Utilization of Minipigs for Biomedical Research. Taitung Animal Propagation Station, Livestock Research Institute, 2010. – 50 p. https://www.angrin.tlri.gov.tw/meeting/2011Inter_Sym/19_Lanyu.pdf
21. Essen M.G. Phänotypische Charakterisierung des Wachstums ausgewählter Röhrenknochen an Vorder- und Hinterextremität bei Miniaturschweinen der Rasse „Mini-LEWE “mittels quantitative Computertomographie. D. Thesis, Hannover 2012. (in Germany)
22. Latter B.D. Mutant alleles of small effect are primarily responsible for the loss of fitness with slow inbreeding in Drosophila melanogaster. Genetics, 1998; 148(3): 1143-1158.
23. Simianer H., Köhn F.Genetic management of the Gottingen Minipig. J Pharmacol Toxicol Methods, 2010; 62: 221-226. doi: 10.1016/j.vascn.2010.05.004.
Дата добавления: 2020-11-23; просмотров: 112; Мы поможем в написании вашей работы! |
Мы поможем в написании ваших работ!